Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G009401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1U4
Pfam PF12937
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02890.1 : OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT63184 , KQJ87316 , PNT75200 , PNT75201 , PNT76910
Barley -
Wheat TraesCS6A02G047800 , TraesCS7D02G483700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G216700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
2 Sobic.003G001000 - -
3 Sobic.004G182201 - -
4 Sobic.001G191100 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G215900 OsFBX172 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G096000 expressed protein -
7 Sobic.002G053000 expressed protein -
8 Sobic.006G273200 "PKc_like super family, protein kjinases, catalytic domain"(PubMedID : 29491869)@protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
9 Sobic.003G174450 - -
10 Sobic.004G003501 - -
11 Sobic.003G362000 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase, putative, expressed K02527: kdtA, 3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase
12 Sobic.001G284800 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
13 Sobic.005G072500 amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.010G136600 - -
15 Sobic.004G317100 DENN domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G498600 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed K12591: RRP6, exosome complex exonuclease RRP6
17 Sobic.003G018900 bromodomain containing protein, expressed K11684: bromodomain-containing factor 1
18 Sobic.003G408500 beclin-1, putative, expressed K08334: BECN, VPS30, beclin
19 Sobic.009G086900 expressed protein -
20 Sobic.009G233300 60S ribosomal protein L18a-1, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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