Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G222700.1
Synonym Sb02g026350
Functional annotation aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed
UniProt C5X282
Pfam PF00026
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF363
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G03200 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g27940.2 : aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014039 , Zm00025a014038 , Zm00025a030627 , Zm00025a048273 , Zm00025a014835 , Zm00025a014836
Brachypodium KQK15916 , KQJ86115 , KQJ90483 , KQJ90482
Barley HORVU5Hr1G067660.1 , HORVU2Hr1G045020.1 , HORVU2Hr1G044940.1 , HORVU5Hr1G067700.1 , HORVU5Hr1G108750.1 , HORVU5Hr1G108750.2 , HORVU5Hr1G108750.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic002G222700 Sobic002G222700 Sobic007G194700 Sobic007G194700 Sobic002G222700--Sobic007G194700 Sobic010G091600 Sobic010G091600 Sobic002G222700--Sobic010G091600 Sobic001G121700 Sobic001G121700 Sobic002G222700--Sobic001G121700 Sobic008G043700 Sobic008G043700 Sobic002G222700--Sobic008G043700 Sobic006G100600 Sobic006G100600 Sobic002G222700--Sobic006G100600 Sobic004G162000 Sobic004G162000 Sobic002G222700--Sobic004G162000 Sobic006G263300 Sobic006G263300 Sobic002G222700--Sobic006G263300 Sobic003G043150 Sobic003G043150 Sobic002G222700--Sobic003G043150 Sobic001G447400 Sobic001G447400 Sobic002G222700--Sobic001G447400 Sobic009G146800 Sobic009G146800 Sobic007G194700--Sobic009G146800 Sobic004G236300 Sobic004G236300 Sobic007G194700--Sobic004G236300 Sobic004G272300 Sobic004G272300 Sobic007G194700--Sobic004G272300 Sobic003G075000 Sobic003G075000 Sobic007G194700--Sobic003G075000 Sobic009G198500 Sobic009G198500 Sobic007G194700--Sobic009G198500 Sobic007G194700--Sobic006G100600 Sobic001G314500 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Octagon: transcription factors


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