Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G025900.1,Sobic.006G025900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJN2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012459
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G038100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
2 Sobic.001G189300 AMP-binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G121900 Annexin arabidopsis 4(PubMedID : 26320239)@annexin, putative, expressed -
4 Sobic.001G052000 aspartic proteinase nepenthesin-1 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.006G026000 - -
6 Sobic.001G032000 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
7 Sobic.003G341600 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
8 Sobic.001G280800 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.008G036800 alkylresorcinol synthase gene preferentially expressed in root hair (PubMedID : 20348430)@Chalcone and stilbene synthase family("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@chalcone synthase, putative, expressed -
10 Sobic.001G131400 thioesterase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G306200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
12 Sobic.003G254300 peroxiredoxin, putative, expressed -
13 Sobic.007G052700 acyl CoA binding protein, putative, expressed K08762: DBI, diazepam-binding inhibitor (GABA receptor modulator, acyl-CoA-binding protein)
14 Sobic.001G034700 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
15 Sobic.010G166500 amino acid transporter, putative, expressed -
16 Sobic.010G178200 hemoglobin-like protein HbO, putative, expressed -
17 Sobic.010G274900 serine/threonine-protein kinase Cx32, chloroplast precursor, putative, expressed -
18 Sobic.008G066200 expressed protein -
19 Sobic.002G012500 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G144900 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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