Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G238400.2
Synonym Sb02g027620
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W5P2
Pfam -
Panther DB PTHR36008 PTHR36008:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G04340 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g30140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014154
Brachypodium KQJ90651
Barley -
Wheat TraesCS5B02G252200 , TraesCS5A02G253300 , TraesCS5D02G261100 , TraesCS5A02G253400 , TraesCS5D02G261200 , TraesCS5B02G252400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G028500 expressed protein -
2 Sobic.001G389200 endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, putative, expressed -
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18 Sobic.001G238700 TRM112, putative, expressed -
19 Sobic.006G180000 syntaxin-18, putative, expressed K08492: syntaxin 18
20 Sobic.001G099900 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14548: UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4


Gene co-expression network
sample Sobic002G238400 Sobic002G238400 Sobic007G028500 Sobic007G028500 Sobic002G238400--Sobic007G028500 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic002G238400--Sobic001G389200 Sobic002G395500 Sobic002G395500 Sobic002G238400--Sobic002G395500 Sobic008G168200 Sobic008G168200 Sobic002G238400--Sobic008G168200 Sobic006G277000 Sobic006G277000 Sobic002G238400--Sobic006G277000 Sobic001G332300 Sobic001G332300 Sobic002G238400--Sobic001G332300 Sobic003G202600 Sobic003G202600 Sobic002G238400--Sobic003G202600 Sobic002G294100 Sobic002G294100 Sobic002G238400--Sobic002G294100 Sobic001G358500 Sobic001G358500 Sobic002G238400--Sobic001G358500 Sobic007G028500--Sobic002G395500 Sobic007G028500--Sobic002G238400 Sobic003G156400 Sobic003G156400 Sobic007G028500--Sobic003G156400 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic007G028500--Sobic002G355800 Sobic004G186900 Sobic004G186900 Sobic007G028500--Sobic004G186900 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic007G028500--Sobic002G200000 Sobic006G012700 Sobic006G012700 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Sobic001G049400 Sobic001G049400 Sobic001G358500--Sobic001G049400 Sobic001G211900 Sobic001G211900 Sobic001G358500--Sobic001G211900
Octagon: transcription factors


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