Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G339732.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6Q1
Pfam -
Panther DB PTHR12358 PTHR12358:SF42
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G21540 : sphingosine kinase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g37580.2 : diacylglycerol kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G104500 growth-regulating factor, putative, expressed -
2 Sobic.005G196600 expressed protein -
3 Sobic.002G168000 expressed protein -
4 Sobic.007G187700 retinoblastoma-related protein-like, putative, expressed K04681: retinoblastoma-like protein 1
5 Sobic.006G275500 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
6 Sobic.004G317000 growth regulating factor protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G055800 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
8 Sobic.006G226000 expressed protein -
9 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G037901 - -
11 Sobic.002G256900 acyl-ACP thioesterase, putative, expressed K10782: fatty acyl-ACP thioesterase A
12 Sobic.004G207766 - -
13 Sobic.006G196600 expressed protein -
14 Sobic.003G001800 expressed protein -
15 Sobic.001G027500 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G016700 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
17 Sobic.009G143200 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G052200 expressed protein -
19 Sobic.010G250400 OsSub52 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
20 Sobic.009G188900 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic002G339732 Sobic002G339732 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic002G339732--Sobic001G104500 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic002G339732--Sobic005G196600 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic002G339732--Sobic002G168000 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic002G339732--Sobic007G187700 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic002G339732--Sobic006G275500 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic002G339732--Sobic004G317000 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic002G339732--Sobic002G055800 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic002G339732--Sobic006G226000 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic002G339732--Sobic005G153000 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic001G104500--Sobic004G282601 Sobic001G104500--Sobic006G275500 Sobic001G104500--Sobic007G187700 Sobic001G104500--Sobic004G317000 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic001G104500--Sobic002G256900 Sobic001G104500--Sobic002G168000 Sobic001G104500--Sobic002G055800 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic001G104500--Sobic006G016700 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic001G104500--Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic005G153000 Sobic005G196600--Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic004G282601 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic005G196600--Sobic009G031800 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic002G055800 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic005G196600--Sobic006G135800 Sobic002G168000--Sobic007G187700 Sobic002G168000--Sobic005G153000 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic002G168000--Sobic002G021200 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic002G168000--Sobic006G281900 Sobic002G168000--Sobic006G275500 Sobic009G188900 Sobic009G188900 Sobic002G168000--Sobic009G188900 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic002G168000--Sobic009G077300 Sobic002G168000--Sobic006G016700 Sobic002G168000--Sobic001G104500 Sobic007G187700--Sobic002G168000 Sobic007G187700--Sobic002G021200 Sobic007G187700--Sobic005G153000 Sobic007G187700--Sobic001G104500 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic007G187700--Sobic001G377700 Sobic007G187700--Sobic006G275500 Sobic007G187700--Sobic004G317000 Sobic007G187700--Sobic004G282601 Sobic007G187700--Sobic009G077300 Sobic006G275500--Sobic006G016700 Sobic006G275500--Sobic001G104500 Sobic006G275500--Sobic002G168000 Sobic003G147500 Sobic003G147500 Sobic006G275500--Sobic003G147500 Sobic006G275500--Sobic007G187700 Sobic008G090000 Sobic008G090000 Sobic006G275500--Sobic008G090000 Sobic006G275500--Sobic009G077300 Sobic006G094100 Sobic006G094100 Sobic006G275500--Sobic006G094100 Sobic009G146250 Sobic009G146250 Sobic006G275500--Sobic009G146250 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic004G317000--Sobic009G143200 Sobic004G317000--Sobic007G187700 Sobic004G317000--Sobic001G104500 Sobic006G196600 Sobic006G196600 Sobic004G317000--Sobic006G196600 Sobic003G282500 Sobic003G282500 Sobic004G317000--Sobic003G282500 Sobic001G238900 Sobic001G238900 Sobic004G317000--Sobic001G238900 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic004G317000--Sobic001G054700 Sobic002G223900 Sobic002G223900 Sobic004G317000--Sobic002G223900 Sobic004G317000--Sobic004G282601 Sobic004G123200 Sobic004G123200 Sobic002G055800--Sobic004G123200 Sobic002G055800--Sobic006G226000 Sobic002G055800--Sobic001G136400 Sobic001G366300 Sobic001G366300 Sobic002G055800--Sobic001G366300 Sobic003G001800 Sobic003G001800 Sobic002G055800--Sobic003G001800 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic002G055800--Sobic009G012500 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic002G055800--Sobic006G083900 Sobic002G240000 Sobic002G240000 Sobic002G055800--Sobic002G240000 Sobic004G142400 Sobic004G142400 Sobic002G055800--Sobic004G142400 Sobic006G226000--Sobic009G031800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic006G226000--Sobic007G160400 Sobic006G226000--Sobic010G037901 Sobic006G226000--Sobic002G055800 Sobic006G226000--Sobic002G256900 Sobic006G226000--Sobic004G123200 Sobic006G226000--Sobic003G086800 Sobic006G226000--Sobic002G240000 Sobic006G226000--Sobic001G136400 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600
Octagon: transcription factors


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