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Transcriptome id Sobic.002G353450.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6Y2
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G120550 - K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.002G399400 expressed protein -
3 Sobic.005G019750 - -
4 Sobic.008G010300 expressed protein -
5 Sobic.007G138100 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G133100 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
7 Sobic.004G232500 dnaJ homolog subfamily C member 7, putative, expressed K09527: DnaJ homolog subfamily C member 7
8 Sobic.008G188400 GNS1/SUR4 membrane family protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G228900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G086700 expressed protein -
11 Sobic.010G043250 - -
12 Sobic.001G114550 - -
13 Sobic.005G074300 - -
14 Sobic.001G316300 DUF623 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G137600 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G113200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.003G335300 E2F-related protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G365700 OsRhmbd13 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
19 Sobic.003G212000 OsCML12 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
20 Sobic.007G141100 expressed protein K18179: cytochrome c oxidase assembly factor 6


Gene co-expression network
sample Sobic002G353450 Sobic002G353450 Sobic004G120550 Sobic004G120550 Sobic002G353450--Sobic004G120550 Sobic002G399400 Sobic002G399400 Sobic002G353450--Sobic002G399400 Sobic005G019750 Sobic005G019750 Sobic002G353450--Sobic005G019750 Sobic008G010300 Sobic008G010300 Sobic002G353450--Sobic008G010300 Sobic007G138100 Sobic007G138100 Sobic002G353450--Sobic007G138100 Sobic003G133100 Sobic003G133100 Sobic002G353450--Sobic003G133100 Sobic004G232500 Sobic004G232500 Sobic002G353450--Sobic004G232500 Sobic008G188400 Sobic008G188400 Sobic002G353450--Sobic008G188400 Sobic002G228900 Sobic002G228900 Sobic002G353450--Sobic002G228900 Sobic004G120550--Sobic005G019750 Sobic004G120550--Sobic008G010300 Sobic004G154100 Sobic004G154100 Sobic004G120550--Sobic004G154100 Sobic010G028900 Sobic010G028900 Sobic004G120550--Sobic010G028900 Sobic009G157800 Sobic009G157800 Sobic004G120550--Sobic009G157800 Sobic010G052900 Sobic010G052900 Sobic004G120550--Sobic010G052900 Sobic009G107140 Sobic009G107140 Sobic004G120550--Sobic009G107140 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic004G120550--Sobic006G267100 Sobic004G120550--Sobic002G353450 Sobic010G043250 Sobic010G043250 Sobic002G399400--Sobic010G043250 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic002G399400--Sobic005G074300 Sobic002G399400--Sobic003G133100 Sobic003G270900 Sobic003G270900 Sobic002G399400--Sobic003G270900 Sobic002G096700 Sobic002G096700 Sobic002G399400--Sobic002G096700 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic002G399400--Sobic008G050900 Sobic002G113200 Sobic002G113200 Sobic002G399400--Sobic002G113200 Sobic002G305200 Sobic002G305200 Sobic002G399400--Sobic002G305200 Sobic008G071300 Sobic008G071300 Sobic002G399400--Sobic008G071300 Sobic005G019750--Sobic004G120550 Sobic005G019750--Sobic008G010300 Sobic005G019750--Sobic002G353450 Sobic005G019750--Sobic010G028900 Sobic001G316300 Sobic001G316300 Sobic005G019750--Sobic001G316300 Sobic005G019750--Sobic009G157800 Sobic005G019750--Sobic004G154100 Sobic005G019750--Sobic002G228900 Sobic006G256000 Sobic006G256000 Sobic005G019750--Sobic006G256000 Sobic008G010300--Sobic004G120550 Sobic008G010300--Sobic005G019750 Sobic008G010300--Sobic010G028900 Sobic008G010300--Sobic010G052900 Sobic002G421350 Sobic002G421350 Sobic008G010300--Sobic002G421350 Sobic008G010300--Sobic009G107140 Sobic004G062200 Sobic004G062200 Sobic008G010300--Sobic004G062200 Sobic008G010300--Sobic004G154100 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic008G010300--Sobic002G368100 Sobic007G138100--Sobic002G113200 Sobic003G212000 Sobic003G212000 Sobic007G138100--Sobic003G212000 Sobic003G137600 Sobic003G137600 Sobic007G138100--Sobic003G137600 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic007G138100--Sobic007G138000 Sobic003G234500 Sobic003G234500 Sobic007G138100--Sobic003G234500 Sobic003G040700 Sobic003G040700 Sobic007G138100--Sobic003G040700 Sobic007G138100--Sobic008G071300 Sobic006G120900 Sobic006G120900 Sobic007G138100--Sobic006G120900 Sobic007G138100--Sobic006G267100 Sobic005G039900 Sobic005G039900 Sobic003G133100--Sobic005G039900 Sobic003G133100--Sobic010G043250 Sobic003G133100--Sobic002G399400 Sobic003G133100--Sobic003G137600 Sobic001G365700 Sobic001G365700 Sobic003G133100--Sobic001G365700 Sobic003G240300 Sobic003G240300 Sobic003G133100--Sobic003G240300 Sobic004G173700 Sobic004G173700 Sobic003G133100--Sobic004G173700 Sobic003G133100--Sobic002G113200 Sobic003G133100--Sobic002G305200 Sobic003G335300 Sobic003G335300 Sobic004G232500--Sobic003G335300 Sobic003G273000 Sobic003G273000 Sobic004G232500--Sobic003G273000 Sobic001G482800 Sobic001G482800 Sobic004G232500--Sobic001G482800 Sobic007G212100 Sobic007G212100 Sobic004G232500--Sobic007G212100 Sobic004G232500--Sobic008G188400 Sobic010G216400 Sobic010G216400 Sobic004G232500--Sobic010G216400 Sobic004G232500--Sobic001G365700 Sobic006G118400 Sobic006G118400 Sobic004G232500--Sobic006G118400 Sobic004G159400 Sobic004G159400 Sobic004G232500--Sobic004G159400 Sobic004G247700 Sobic004G247700 Sobic008G188400--Sobic004G247700 Sobic008G188400--Sobic001G482800 Sobic008G188400--Sobic004G232500 Sobic008G188400--Sobic001G365700 Sobic008G188400--Sobic003G335300 Sobic007G219500 Sobic007G219500 Sobic008G188400--Sobic007G219500 Sobic008G188400--Sobic004G173700 Sobic003G284100 Sobic003G284100 Sobic008G188400--Sobic003G284100 Sobic008G040400 Sobic008G040400 Sobic008G188400--Sobic008G040400 Sobic002G228900--Sobic004G173700 Sobic002G228900--Sobic002G113200 Sobic002G228900--Sobic003G212000 Sobic002G228900--Sobic003G284100 Sobic002G228900--Sobic003G234500 Sobic002G228900--Sobic003G137600 Sobic003G089100 Sobic003G089100 Sobic002G228900--Sobic003G089100 Sobic002G228900--Sobic009G157800 Sobic002G255400 Sobic002G255400 Sobic002G228900--Sobic002G255400
Octagon: transcription factors


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