Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G375701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7E3
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33160 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42590.1 : OsFBX258 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015220 , Zm00025a048764
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G030810.1 , HORVU2Hr1G030810.2 , HORVU2Hr1G030810.3
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G351100 DNA repair protein Rad51, putative, expressed K04482: DNA repair protein RAD51
2 Sobic.004G323200 SCP-like extracellular protein, expressed -
3 Sobic.009G026650 - -
4 Sobic.009G224700 anti-silencing protein, ASF1-like domain containing protein, expressed K10753: histone chaperone ASF1
5 Sobic.001G078700 Homologous to Dof genes in Arabidopsis and rice.(PubMedID : 21161392)@dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G315400 expressed protein -
7 Sobic.009G194900 glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like protein 3 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.003G107200 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12198: CHMP5, charged multivesicular body protein 5
9 Sobic.002G274500 LRP1, putative, expressed -
10 Sobic.010G079100 lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.009G188300 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G200000 RNA recognition motif, putative, expressed -
13 Sobic.010G086000 cyclin, putative, expressed K18810: cyclin D1/2/4, plant
14 Sobic.009G102100 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G120700 N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol de-N-acetylase, putative, expressed K03434: N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase
16 Sobic.001G080200 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
17 Sobic.001G300400 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G286100 DUF292 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.010G177100 expressed protein -
20 Sobic.006G267800 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G375701 Sobic002G375701 Sobic002G351100 Sobic002G351100 Sobic002G375701--Sobic002G351100 Sobic004G323200 Sobic004G323200 Sobic002G375701--Sobic004G323200 Sobic009G026650 Sobic009G026650 Sobic002G375701--Sobic009G026650 Sobic009G224700 Sobic009G224700 Sobic002G375701--Sobic009G224700 Sobic001G078700 Sobic001G078700 Sobic002G375701--Sobic001G078700 Sobic002G315400 Sobic002G315400 Sobic002G375701--Sobic002G315400 Sobic009G194900 Sobic009G194900 Sobic002G375701--Sobic009G194900 Sobic003G107200 Sobic003G107200 Sobic002G375701--Sobic003G107200 Sobic002G274500 Sobic002G274500 Sobic002G375701--Sobic002G274500 Sobic001G300400 Sobic001G300400 Sobic002G351100--Sobic001G300400 Sobic003G297200 Sobic003G297200 Sobic002G351100--Sobic003G297200 Sobic001G521100 Sobic001G521100 Sobic002G351100--Sobic001G521100 Sobic003G244000 Sobic003G244000 Sobic002G351100--Sobic003G244000 Sobic002G351100--Sobic002G315400 Sobic002G351100--Sobic009G194900 Sobic001G440900 Sobic001G440900 Sobic002G351100--Sobic001G440900 Sobic002G246900 Sobic002G246900 Sobic002G351100--Sobic002G246900 Sobic001G238900 Sobic001G238900 Sobic002G351100--Sobic001G238900 Sobic001G080200 Sobic001G080200 Sobic004G323200--Sobic001G080200 Sobic010G079100 Sobic010G079100 Sobic004G323200--Sobic010G079100 Sobic006G235600 Sobic006G235600 Sobic004G323200--Sobic006G235600 Sobic010G241100 Sobic010G241100 Sobic004G323200--Sobic010G241100 Sobic003G320300 Sobic003G320300 Sobic004G323200--Sobic003G320300 Sobic004G238801 Sobic004G238801 Sobic004G323200--Sobic004G238801 Sobic010G086000 Sobic010G086000 Sobic004G323200--Sobic010G086000 Sobic001G146900 Sobic001G146900 Sobic004G323200--Sobic001G146900 Sobic002G146601 Sobic002G146601 Sobic004G323200--Sobic002G146601 Sobic001G468000 Sobic001G468000 Sobic009G026650--Sobic001G468000 Sobic001G101700 Sobic001G101700 Sobic009G026650--Sobic001G101700 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic009G026650--Sobic006G272800 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic009G026650--Sobic006G221300 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic009G026650--Sobic009G225500 Sobic003G345000 Sobic003G345000 Sobic009G026650--Sobic003G345000 Sobic002G279400 Sobic002G279400 Sobic009G026650--Sobic002G279400 Sobic009G026650--Sobic002G274500 Sobic004G162900 Sobic004G162900 Sobic009G026650--Sobic004G162900 Sobic001G286300 Sobic001G286300 Sobic009G224700--Sobic001G286300 Sobic009G120100 Sobic009G120100 Sobic009G224700--Sobic009G120100 Sobic002G222900 Sobic002G222900 Sobic009G224700--Sobic002G222900 Sobic002G308300 Sobic002G308300 Sobic009G224700--Sobic002G308300 Sobic001G347901 Sobic001G347901 Sobic009G224700--Sobic001G347901 Sobic009G016500 Sobic009G016500 Sobic009G224700--Sobic009G016500 Sobic002G309700 Sobic002G309700 Sobic009G224700--Sobic002G309700 Sobic002G331300 Sobic002G331300 Sobic009G224700--Sobic002G331300 Sobic001G128400 Sobic001G128400 Sobic009G224700--Sobic001G128400 Sobic006G102900 Sobic006G102900 Sobic001G078700--Sobic006G102900 Sobic003G034600 Sobic003G034600 Sobic001G078700--Sobic003G034600 Sobic001G078700--Sobic003G107200 Sobic003G307400 Sobic003G307400 Sobic001G078700--Sobic003G307400 Sobic004G263700 Sobic004G263700 Sobic001G078700--Sobic004G263700 Sobic006G200000 Sobic006G200000 Sobic001G078700--Sobic006G200000 Sobic010G190300 Sobic010G190300 Sobic001G078700--Sobic010G190300 Sobic003G300900 Sobic003G300900 Sobic001G078700--Sobic003G300900 Sobic010G138300 Sobic010G138300 Sobic001G078700--Sobic010G138300 Sobic002G315400--Sobic001G521100 Sobic002G092200 Sobic002G092200 Sobic002G315400--Sobic002G092200 Sobic002G315400--Sobic002G351100 Sobic002G236700 Sobic002G236700 Sobic002G315400--Sobic002G236700 Sobic009G109300 Sobic009G109300 Sobic002G315400--Sobic009G109300 Sobic003G412800 Sobic003G412800 Sobic002G315400--Sobic003G412800 Sobic002G315400--Sobic003G297200 Sobic002G315400--Sobic002G246900 Sobic007G112100 Sobic007G112100 Sobic002G315400--Sobic007G112100 Sobic001G261549 Sobic001G261549 Sobic009G194900--Sobic001G261549 Sobic009G194900--Sobic002G351100 Sobic009G194900--Sobic006G102900 Sobic009G194900--Sobic003G107200 Sobic001G255600 Sobic001G255600 Sobic009G194900--Sobic001G255600 Sobic006G134200 Sobic006G134200 Sobic009G194900--Sobic006G134200 Sobic002G230800 Sobic002G230800 Sobic009G194900--Sobic002G230800 Sobic009G194900--Sobic002G246900 Sobic004G047100 Sobic004G047100 Sobic009G194900--Sobic004G047100 Sobic003G107200--Sobic006G102900 Sobic003G107200--Sobic002G246900 Sobic003G107200--Sobic004G047100 Sobic009G181500 Sobic009G181500 Sobic003G107200--Sobic009G181500 Sobic003G107200--Sobic001G261549 Sobic007G154500 Sobic007G154500 Sobic003G107200--Sobic007G154500 Sobic001G078600 Sobic001G078600 Sobic003G107200--Sobic001G078600 Sobic003G107200--Sobic002G236700 Sobic002G426800 Sobic002G426800 Sobic003G107200--Sobic002G426800 Sobic009G137500 Sobic009G137500 Sobic002G274500--Sobic009G137500 Sobic006G105600 Sobic006G105600 Sobic002G274500--Sobic006G105600 Sobic004G052200 Sobic004G052200 Sobic002G274500--Sobic004G052200 Sobic006G124400 Sobic006G124400 Sobic002G274500--Sobic006G124400 Sobic009G208300 Sobic009G208300 Sobic002G274500--Sobic009G208300 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic002G274500--Sobic003G366000 Sobic002G274500--Sobic004G162900 Sobic009G188500 Sobic009G188500 Sobic002G274500--Sobic009G188500 Sobic006G041700 Sobic006G041700 Sobic002G274500--Sobic006G041700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.