Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G416250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QG95
Pfam -
Panther DB PTHR35722
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35900 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g56470.1 : mal d 1-associated protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027393
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G306900 , TraesCS3A02G296100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141100 OsFBO6 - F-box and other domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G120000 - -
3 Sobic.005G030700 MATH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G112800 expressed protein -
5 Sobic.002G018100 - -
6 Sobic.009G228201 - -
7 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
8 Sobic.003G097900 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G051200 OsSub49 - Putative Subtilisin homologue, expressed K08653: membrane-bound transcription factor site-1 protease
10 Sobic.009G051500 expressed protein -
11 Sobic.001G408500 alpha-taxilin, putative, expressed -
12 Sobic.001G523800 anthranilate phosphoribosyltransferase, chloroplast precursor, putative, expressed K00766: anthranilate phosphoribosyltransferase
13 Sobic.007G005200 PHD-finger domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G028600 expressed protein -
15 Sobic.003G074801 - -
16 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
17 Sobic.003G015000 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
18 Sobic.007G143250 - -
19 Sobic.008G184300 expressed protein -
20 Sobic.008G037400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G416250 Sobic002G416250 Sobic006G141100 Sobic006G141100 Sobic002G416250--Sobic006G141100 Sobic008G120000 Sobic008G120000 Sobic002G416250--Sobic008G120000 Sobic005G030700 Sobic005G030700 Sobic002G416250--Sobic005G030700 Sobic004G112800 Sobic004G112800 Sobic002G416250--Sobic004G112800 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic002G416250--Sobic002G018100 Sobic009G228201 Sobic009G228201 Sobic002G416250--Sobic009G228201 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G416250--Sobic005G128000 Sobic003G097900 Sobic003G097900 Sobic002G416250--Sobic003G097900 Sobic010G051200 Sobic010G051200 Sobic002G416250--Sobic010G051200 Sobic006G141100--Sobic004G112800 Sobic007G005200 Sobic007G005200 Sobic006G141100--Sobic007G005200 Sobic002G139700 Sobic002G139700 Sobic006G141100--Sobic002G139700 Sobic010G056100 Sobic010G056100 Sobic006G141100--Sobic010G056100 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic006G141100--Sobic010G063433 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic006G141100--Sobic001G028600 Sobic009G051500 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Octagon: transcription factors


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