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Transcriptome id Sobic.003G003101.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0L1
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G086900 C2 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G500300 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13091: RBM39, RNA-binding protein 39
3 Sobic.002G421000 expressed protein -
4 Sobic.001G529600 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
5 Sobic.002G040800 CAMK_CAMK_like.31 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
6 Sobic.010G077400 nitrilase, putative, expressed K13566: NIT2, omega-amidase
7 Sobic.010G228700 ATCPSF30/CPSF30, putative, expressed K14404: CPSF4, cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
8 Sobic.004G135300 - -
9 Sobic.006G131500 serine/threonine-protein kinase GCN2, putative, expressed K16196: eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 4
10 Sobic.001G222250 - -
11 Sobic.006G153900 transporter, major facilitator family, putative, expressed -
12 Sobic.001G072500 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
13 Sobic.005G122700 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G008800 WD domain and HEAT domain containing protein, putative, expressed K07204: regulatory associated protein of mTOR
15 Sobic.002G373100 strictosidine synthase, putative, expressed -
16 Sobic.004G182201 - -
17 Sobic.010G143800 expressed protein -
18 Sobic.009G139000 - -
19 Sobic.001G289800 BAH domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G339300 myosin-Vb, putative, expressed K10357: myosin V


Gene co-expression network
sample Sobic003G003101 Sobic003G003101 Sobic003G086900 Sobic003G086900 Sobic003G003101--Sobic003G086900 Sobic001G500300 Sobic001G500300 Sobic003G003101--Sobic001G500300 Sobic002G421000 Sobic002G421000 Sobic003G003101--Sobic002G421000 Sobic001G529600 Sobic001G529600 Sobic003G003101--Sobic001G529600 Sobic002G040800 Sobic002G040800 Sobic003G003101--Sobic002G040800 Sobic010G077400 Sobic010G077400 Sobic003G003101--Sobic010G077400 Sobic010G228700 Sobic010G228700 Sobic003G003101--Sobic010G228700 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic003G003101--Sobic004G135300 Sobic006G131500 Sobic006G131500 Sobic003G003101--Sobic006G131500 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic003G086900--Sobic007G193700 Sobic006G225900 Sobic006G225900 Sobic003G086900--Sobic006G225900 Sobic010G196500 Sobic010G196500 Sobic003G086900--Sobic010G196500 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic003G086900--Sobic004G174200 Sobic001G016700 Sobic001G016700 Sobic003G086900--Sobic001G016700 Sobic001G390800 Sobic001G390800 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Octagon: transcription factors


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