Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G004100.1
Synonym Sb03g000540
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q0L0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G27840 : SNARE-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a058225 , Zm00025a022795 , Zm00025a024554 , Zm00025a012627 , Zm00025a008591
Brachypodium KQK03478
Barley HORVU3Hr1G032120.4 , HORVU3Hr1G032120.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G129201 - -
2 Sobic.007G118500 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G151200 RNA-binding protein-like, putative, expressed -
4 Sobic.002G422400 adenylate cyclase family protein, expressed -
5 Sobic.002G186300 serine/threonine-protein kinase 16, putative, expressed K08856: serine/threonine kinase 16
6 Sobic.006G237200 vacuolar ATP synthase subunit D 1, putative, expressed K02149: ATPeV1D, V-type H+-transporting ATPase subunit D
7 Sobic.002G367800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G007700 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.007G048700 stomatin-like protein 2, putative, expressed -
10 Sobic.003G202100 Uncharacterized ACR, COG1565 containing protein, putative, expressed K18164: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 7
11 Sobic.004G184000 SFT2, putative, expressed -
12 Sobic.001G533100 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K05305: fucokinase
13 Sobic.001G455000 glycosyl hydrolase, family 31, putative, expressed K05546: mannosyl-oligosaccharide alpha-1,3-glucosidase
14 Sobic.002G070600 coatomer subunit gamma-2, putative, expressed K17267: coatomer subunit gamma
15 Sobic.002G070300 expressed protein -
16 Sobic.004G060300 DNA binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G005900 abscisic acid insensitive 8, putative, expressed -
18 Sobic.006G020900 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
19 Sobic.001G088200 strictosidine synthase, putative, expressed -
20 Sobic.008G072200 coatomer subunit delta, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G004100 Sobic003G004100 Sobic005G129201 Sobic005G129201 Sobic003G004100--Sobic005G129201 Sobic007G118500 Sobic007G118500 Sobic003G004100--Sobic007G118500 Sobic004G151200 Sobic004G151200 Sobic003G004100--Sobic004G151200 Sobic002G422400 Sobic002G422400 Sobic003G004100--Sobic002G422400 Sobic002G186300 Sobic002G186300 Sobic003G004100--Sobic002G186300 Sobic006G237200 Sobic006G237200 Sobic003G004100--Sobic006G237200 Sobic002G367800 Sobic002G367800 Sobic003G004100--Sobic002G367800 Sobic004G007700 Sobic004G007700 Sobic003G004100--Sobic004G007700 Sobic007G048700 Sobic007G048700 Sobic003G004100--Sobic007G048700 Sobic004G184000 Sobic004G184000 Sobic005G129201--Sobic004G184000 Sobic007G173000 Sobic007G173000 Sobic005G129201--Sobic007G173000 Sobic005G129201--Sobic002G367800 Sobic005G129201--Sobic003G004100 Sobic001G533100 Sobic001G533100 Sobic005G129201--Sobic001G533100 Sobic001G116000 Sobic001G116000 Sobic005G129201--Sobic001G116000 Sobic001G088200 Sobic001G088200 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Octagon: transcription factors


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