Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G038200.1
Synonym
Functional annotation PPR repeat containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q1A1
Pfam PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF885
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09820 : Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34310.1 : PPR repeat containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023127
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G038200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.001G143900 expressed protein -
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17 Sobic.003G326900 expressed protein -
18 Sobic.005G132700 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed K00670: NAA30, N-alpha-acetyltransferase 30
19 Sobic.003G194300 50S ribosomal protein, putative, expressed K02914: RP-L34, MRPL34, large subunit ribosomal protein L34
20 Sobic.006G012700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G038200 Sobic003G038200 Sobic008G168200 Sobic008G168200 Sobic003G038200--Sobic008G168200 Sobic002G238400 Sobic002G238400 Sobic003G038200--Sobic002G238400 Sobic001G205100 Sobic001G205100 Sobic003G038200--Sobic001G205100 Sobic010G133400 Sobic010G133400 Sobic003G038200--Sobic010G133400 Sobic002G395500 Sobic002G395500 Sobic003G038200--Sobic002G395500 Sobic001G304000 Sobic001G304000 Sobic003G038200--Sobic001G304000 Sobic007G049900 Sobic007G049900 Sobic003G038200--Sobic007G049900 Sobic002G422400 Sobic002G422400 Sobic003G038200--Sobic002G422400 Sobic009G218000 Sobic009G218000 Sobic003G038200--Sobic009G218000 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic008G168200--Sobic001G389200 Sobic008G168200--Sobic001G205100 Sobic008G168200--Sobic002G395500 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic008G168200--Sobic006G060000 Sobic003G156400 Sobic003G156400 Sobic008G168200--Sobic003G156400 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic008G168200--Sobic003G394500 Sobic006G012700 Sobic006G012700 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Octagon: transcription factors


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