Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G206800.1,Sobic.003G206800.2
Synonym Sb03g026830
Functional annotation DUF538 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XPM5
Pfam PF04398
Panther DB PTHR31676 PTHR31676:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19590 : Protein of unknown function, DUF538
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41220.2 : DUF538 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038447
Brachypodium KQK08566
Barley HORVU3Hr1G051910.1 , HORVU3Hr1G051910.2
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G206800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G048800 expressed protein -
2 Sobic.001G320200 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
3 Sobic.001G340700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@EARLY flowering protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G314500 expressed protein -
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10 Sobic.009G174000 expressed protein -
11 Sobic.004G174100 expressed protein -
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13 Sobic.006G216900 expressed protein -
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17 Sobic.003G412700 serine palmitoyltransferase 2, putative, expressed K00654: serine palmitoyltransferase
18 Sobic.010G277100 regulator of ribonuclease, putative, expressed -
19 Sobic.002G193400 lipase, putative, expressed K18875: enhanced disease susceptibility 1 protein
20 Sobic.005G032300 ubiquitin-like protein 5, putative, expressed K13113: UBL5, ubiquitin-like protein 5


Gene co-expression network
sample Sobic003G206800 Sobic003G206800 Sobic002G048800 Sobic002G048800 Sobic003G206800--Sobic002G048800 Sobic001G320200 Sobic001G320200 Sobic003G206800--Sobic001G320200 Sobic001G340700 Sobic001G340700 Sobic003G206800--Sobic001G340700 Sobic003G314500 Sobic003G314500 Sobic003G206800--Sobic003G314500 Sobic002G130700 Sobic002G130700 Sobic003G206800--Sobic002G130700 Sobic008G001400 Sobic008G001400 Sobic003G206800--Sobic008G001400 Sobic002G073900 Sobic002G073900 Sobic003G206800--Sobic002G073900 Sobic008G142600 Sobic008G142600 Sobic003G206800--Sobic008G142600 Sobic001G427200 Sobic001G427200 Sobic003G206800--Sobic001G427200 Sobic002G048800--Sobic003G206800 Sobic002G193400 Sobic002G193400 Sobic002G048800--Sobic002G193400 Sobic002G048800--Sobic002G073900 Sobic003G402200 Sobic003G402200 Sobic002G048800--Sobic003G402200 Sobic002G048800--Sobic008G142600 Sobic009G110500 Sobic009G110500 Sobic002G048800--Sobic009G110500 Sobic003G135800 Sobic003G135800 Sobic002G048800--Sobic003G135800 Sobic004G349300 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Octagon: transcription factors


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