Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G073000.1
Synonym Sb04g006075
Functional annotation GA20292-PA, putative, expressed
UniProt A0A194YN60
Pfam PF05627
Panther DB PTHR33159 PTHR33159:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g09630.1 : GA20292-PA, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019371
Brachypodium KQJ93761
Barley HORVU0Hr1G016170.2
Wheat TraesCS6A02G172000 , TraesCS6A02G172000 , TraesCS6D02G161400 , TraesCS6A02G172000 , TraesCS6B02G199900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G497800 DUF623 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G088000 expressed protein -
3 Sobic.010G158832 - -
4 Sobic.006G031400 expressed protein -
5 Sobic.009G166650 - -
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9 Sobic.003G145200 expressed protein -
10 Sobic.004G073800 STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 7 precursor, putative, expressed -
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12 Sobic.006G137300 methyladenine glycosylase, putative, expressed K01246: DNA-3-methyladenine glycosylase I
13 Sobic.003G306000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
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16 Sobic.001G230300 shugoshin-1, putative, expressed -
17 Sobic.010G058400 expressed protein -
18 Sobic.006G234500 OsFBD10 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G306500 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12194: CHMP4, SNF7, charged multivesicular body protein 4
20 Sobic.002G095800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G073000 Sobic004G073000 Sobic001G497800 Sobic001G497800 Sobic004G073000--Sobic001G497800 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic004G073000--Sobic001G088000 Sobic010G158832 Sobic010G158832 Sobic004G073000--Sobic010G158832 Sobic006G031400 Sobic006G031400 Sobic004G073000--Sobic006G031400 Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic004G073000--Sobic009G166650 Sobic009G192700 Sobic009G192700 Sobic004G073000--Sobic009G192700 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic004G073000--Sobic002G074500 Sobic001G265500 Sobic001G265500 Sobic004G073000--Sobic001G265500 Sobic003G145200 Sobic003G145200 Sobic004G073000--Sobic003G145200 Sobic010G058400 Sobic010G058400 Sobic001G497800--Sobic010G058400 Sobic001G497800--Sobic002G074500 Sobic004G299200 Sobic004G299200 Sobic001G497800--Sobic004G299200 Sobic003G049000 Sobic003G049000 Sobic001G497800--Sobic003G049000 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic001G497800--Sobic006G234500 Sobic004G205700 Sobic004G205700 Sobic001G497800--Sobic004G205700 Sobic003G092000 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Octagon: transcription factors


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