Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G124100.7,Sobic.004G124100.4,Sobic.004G124100.5,Sobic.004G124100.6
Synonym Sb04g010360
Functional annotation EMB1303, putative, expressed
UniProt A0A194YPA3
Pfam -
Panther DB PTHR34938 PTHR34938:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G30475 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g17380.1 : EMB1303, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019816
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G291400 rho guanine nucleotide exchange factor, putative, expressed -
2 Sobic.001G468600 seryl-tRNA synthetase, putative, expressed K01875: SARS, seryl-tRNA synthetase
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8 Sobic.005G105500 expressed protein -
9 Sobic.008G103800 expressed protein -
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11 Sobic.009G045900 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01892: HARS, histidyl-tRNA synthetase
12 Sobic.009G124000 mesophyll envelope protein(PubMedID : 26976818)@expressed protein -
13 Sobic.009G249800 AARP2CN domain containing protein, expressed K14799: pre-rRNA-processing protein TSR1
14 Sobic.008G103900 glycine-rich RNA-binding protein 7, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
15 Sobic.002G341800 eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma, putative, expressed K03242: translation initiation factor 2 subunit 3
16 Sobic.008G135200 importin subunit beta, putative, expressed K14293: KPNB1, importin subunit beta-1
17 Sobic.006G216000 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G061400 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09539: DnaJ homolog subfamily C member 19
19 Sobic.009G072000 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01933: phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase
20 Sobic.006G020900 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G124100 Sobic004G124100 Sobic004G291400 Sobic004G291400 Sobic004G124100--Sobic004G291400 Sobic001G468600 Sobic001G468600 Sobic004G124100--Sobic001G468600 Sobic006G002201 Sobic006G002201 Sobic004G124100--Sobic006G002201 Sobic004G248900 Sobic004G248900 Sobic004G124100--Sobic004G248900 Sobic006G010400 Sobic006G010400 Sobic004G124100--Sobic006G010400 Sobic006G157000 Sobic006G157000 Sobic004G124100--Sobic006G157000 Sobic008G118600 Sobic008G118600 Sobic004G124100--Sobic008G118600 Sobic005G105500 Sobic005G105500 Sobic004G124100--Sobic005G105500 Sobic008G103800 Sobic008G103800 Sobic004G124100--Sobic008G103800 Sobic004G291400--Sobic005G105500 Sobic006G216000 Sobic006G216000 Sobic004G291400--Sobic006G216000 Sobic004G291400--Sobic006G002201 Sobic006G020900 Sobic006G020900 Sobic004G291400--Sobic006G020900 Sobic003G196800 Sobic003G196800 Sobic004G291400--Sobic003G196800 Sobic004G291400--Sobic004G124100 Sobic002G341800 Sobic002G341800 Sobic004G291400--Sobic002G341800 Sobic005G111900 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Octagon: transcription factors


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