Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G135200.2,Sobic.004G135200.5,Sobic.004G135200.6,Sobic.004G135200.4,Sobic.004G135200.3
Synonym Sb04g014190
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RMS2 , A0A1Z5RMG6 , A0A194YQL2 , A0A1Z5RM93 , A0A1Z5RMD1
Pfam PF10497
Panther DB PTHR31169 PTHR31169:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G67780 : Zinc-finger domain of monoamine-oxidase A repressor R1 protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g23530.4,LOC_Os05g23530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031416
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G216300 RNA recognition motif containing protein, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
2 Sobic.009G231700 GTP binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G176700 expressed protein -
4 Sobic.002G308500 peptide-Nasparagine amidase, putative, expressed K01456: E3.5.1.52, NGLY1, peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase
5 Sobic.004G204100 expressed protein -
6 Sobic.001G382600 expressed protein -
7 Sobic.009G088000 expressed protein -
8 Sobic.001G426600 SH3 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G412700 histone-arginine methyltransferase CARM1, putative, expressed K05931: CARM1, type I protein arginine methyltransferase
10 Sobic.001G536000 actin, putative, expressed K11340: ACTL6A, actin-like protein 6A
11 Sobic.004G039600 proteasome/cyclosome repeat containing protein, expressed K03028: PSMD2, 26S proteasome regulatory subunit N1
12 Sobic.003G375200 mitotic checkpoint family protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G088851 - -
14 Sobic.008G091300 PolI-like DNA polymerase, putative, expressed K02349: DNA polymerase theta
15 Sobic.002G127400 glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G142100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K04536: guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1
17 Sobic.005G163700 T-complex protein, putative, expressed K09500: T-complex protein 1 subunit theta
18 Sobic.001G404600 expressed protein K18270: Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit
19 Sobic.009G049400 "SRS3(Ortholog in rice:Kitagawa et al., 2010)"(PubMedID : 31659920)@ATKINESIN-13A/KINESIN-13A, putative, expressed K10393: KIF2_24, kinesin family member 2/24
20 Sobic.003G029600 coatomer alpha subunit, putative, expressed K05236: COPA, coatomer subunit alpha


Gene co-expression network
sample Sobic004G135200 Sobic004G135200 Sobic005G216300 Sobic005G216300 Sobic004G135200--Sobic005G216300 Sobic009G231700 Sobic009G231700 Sobic004G135200--Sobic009G231700 Sobic009G176700 Sobic009G176700 Sobic004G135200--Sobic009G176700 Sobic002G308500 Sobic002G308500 Sobic004G135200--Sobic002G308500 Sobic004G204100 Sobic004G204100 Sobic004G135200--Sobic004G204100 Sobic001G382600 Sobic001G382600 Sobic004G135200--Sobic001G382600 Sobic009G088000 Sobic009G088000 Sobic004G135200--Sobic009G088000 Sobic001G426600 Sobic001G426600 Sobic004G135200--Sobic001G426600 Sobic002G412700 Sobic002G412700 Sobic004G135200--Sobic002G412700 Sobic003G099300 Sobic003G099300 Sobic005G216300--Sobic003G099300 Sobic007G027700 Sobic007G027700 Sobic005G216300--Sobic007G027700 Sobic004G039600 Sobic004G039600 Sobic005G216300--Sobic004G039600 Sobic001G369000 Sobic001G369000 Sobic005G216300--Sobic001G369000 Sobic001G335900 Sobic001G335900 Sobic005G216300--Sobic001G335900 Sobic005G216300--Sobic001G426600 Sobic001G142100 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Octagon: transcription factors


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