Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G150200.1
Synonym Sb04g020040
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XSG5
Pfam -
Panther DB PTHR36338 PTHR36338:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G79390 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g29320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020359
Brachypodium KQJ99524
Barley HORVU5Hr1G106970.1
Wheat TraesCS5B02G450900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G025600 huntingtin-interacting protein HYPK, putative, expressed -
2 Sobic.003G277000 expressed protein -
3 Sobic.009G168000 selT-like protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G127100 expressed protein -
5 Sobic.001G129400 ribosomal protein-related, putative, expressed K02970: RP-S21, MRPS21, small subunit ribosomal protein S21
6 Sobic.002G309500 ras-related protein, putative, expressed K07893: Ras-related protein Rab-6A
7 Sobic.003G305100 expressed protein -
8 Sobic.008G127500 expressed protein -
9 Sobic.007G091000 thioredoxin domain-containing protein 9, putative, expressed -
10 Sobic.006G281200 csAtPR5, putative, expressed -
11 Sobic.008G100000 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
12 Sobic.004G262300 thioredoxin reductase 2, putative, expressed K00384: trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
13 Sobic.004G103700 ribosomal protein, putative, expressed K02866: RP-L10e, large subunit ribosomal protein L10e
14 Sobic.001G095632 - -
15 Sobic.003G326900 expressed protein -
16 Sobic.001G451901 - -
17 Sobic.001G441000 erwinia induced protein 2, putative, expressed -
18 Sobic.001G538600 rhodanese, putative, expressed K18065: Cdc25 family phosphatase
19 Sobic.003G322300 expressed protein -
20 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other


Gene co-expression network
sample Sobic004G150200 Sobic004G150200 Sobic001G025600 Sobic001G025600 Sobic004G150200--Sobic001G025600 Sobic003G277000 Sobic003G277000 Sobic004G150200--Sobic003G277000 Sobic009G168000 Sobic009G168000 Sobic004G150200--Sobic009G168000 Sobic005G127100 Sobic005G127100 Sobic004G150200--Sobic005G127100 Sobic001G129400 Sobic001G129400 Sobic004G150200--Sobic001G129400 Sobic002G309500 Sobic002G309500 Sobic004G150200--Sobic002G309500 Sobic003G305100 Sobic003G305100 Sobic004G150200--Sobic003G305100 Sobic008G127500 Sobic008G127500 Sobic004G150200--Sobic008G127500 Sobic007G091000 Sobic007G091000 Sobic004G150200--Sobic007G091000 Sobic004G103700 Sobic004G103700 Sobic001G025600--Sobic004G103700 Sobic001G172000 Sobic001G172000 Sobic001G025600--Sobic001G172000 Sobic001G481700 Sobic001G481700 Sobic001G025600--Sobic001G481700 Sobic003G129800 Sobic003G129800 Sobic001G025600--Sobic003G129800 Sobic001G513500 Sobic001G513500 Sobic001G025600--Sobic001G513500 Sobic003G442400 Sobic003G442400 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Octagon: transcription factors


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