Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G179700.1
Synonym Sb04g022930
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XUW3
Pfam -
Panther DB PTHR33646
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10080 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g35220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031626 , Zm00025a020713
Brachypodium PNT68839 , KQJ99912 , KQJ99913
Barley HORVU6Hr1G047910.1
Wheat TraesCS6A02G188200 , TraesCS6B02G218600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G179700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G131100 transmembrane BAX inhibitor motif-containing protein, putative, expressed K06890: uncharacterized protein
2 Sobic.007G079700 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.001G206000 acyltransferase, putative, expressed K00655: 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase
4 Sobic.001G285000 - -
5 Sobic.006G262900 expressed protein -
6 Sobic.001G225600 expressed protein -
7 Sobic.009G199700 expressed protein -
8 Sobic.002G335400 OsFBX250 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G277000 expressed protein -
10 Sobic.004G217600 expressed protein -
11 Sobic.009G156300 pleckstrin homology domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G013600 expressed protein -
13 Sobic.002G273900 expressed protein -
14 Sobic.002G123200 DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit domain containing protein, expressed K03009: RPB12, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
15 Sobic.010G066300 OsRCI2-8 - Putative low temperature and salt responsive protein, expressed -
16 Sobic.009G077100 expressed protein -
17 Sobic.004G060600 expressed protein K13105: proline-rich protein PRCC
18 Sobic.003G127300 expressed protein -
19 Sobic.001G530350 - -
20 Sobic.001G447900 OsFBO13 - F-box and other domain containing protein, expressed K10293: F-box protein 7


Gene co-expression network
sample Sobic004G179700 Sobic004G179700 Sobic009G131100 Sobic009G131100 Sobic004G179700--Sobic009G131100 Sobic007G079700 Sobic007G079700 Sobic004G179700--Sobic007G079700 Sobic001G206000 Sobic001G206000 Sobic004G179700--Sobic001G206000 Sobic001G285000 Sobic001G285000 Sobic004G179700--Sobic001G285000 Sobic006G262900 Sobic006G262900 Sobic004G179700--Sobic006G262900 Sobic001G225600 Sobic001G225600 Sobic004G179700--Sobic001G225600 Sobic009G199700 Sobic009G199700 Sobic004G179700--Sobic009G199700 Sobic002G335400 Sobic002G335400 Sobic004G179700--Sobic002G335400 Sobic003G277000 Sobic003G277000 Sobic004G179700--Sobic003G277000 Sobic001G536500 Sobic001G536500 Sobic009G131100--Sobic001G536500 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic009G131100--Sobic002G078400 Sobic004G060600 Sobic004G060600 Sobic009G131100--Sobic004G060600 Sobic007G091000 Sobic007G091000 Sobic009G131100--Sobic007G091000 Sobic010G194900 Sobic010G194900 Sobic009G131100--Sobic010G194900 Sobic009G131100--Sobic003G277000 Sobic001G087900 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Octagon: transcription factors


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