Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G280401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPJ9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G33055 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g28614.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK16345 , KQJ84192
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G171501 - -
2 Sobic.003G325700 expressed protein -
3 Sobic.001G280700 acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
4 Sobic.001G345400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ring-H2 zinc finger protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G234000 expressed protein -
6 Sobic.004G110400 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G130400 expressed protein -
8 Sobic.003G277500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@methyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.004G333300 serine-rich protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G070200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@LTPL84 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.005G155600 LYK, putative, expressed -
12 Sobic.001G234300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, RING-type, putative, expressed -
13 Sobic.010G021100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K12734: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3
14 Sobic.003G271201 - -
15 Sobic.004G078900 AGAP003371-PA, putative, expressed -
16 Sobic.009G149800 subtilisin N-terminal Region family protein, expressed -
17 Sobic.006G108600 prohibitin, putative, expressed K17080: prohibitin 1
18 Sobic.010G250600 expressed protein -
19 Sobic.010G175900 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
20 Sobic.001G052200 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G280401 Sobic004G280401 Sobic010G171501 Sobic010G171501 Sobic004G280401--Sobic010G171501 Sobic003G325700 Sobic003G325700 Sobic004G280401--Sobic003G325700 Sobic001G280700 Sobic001G280700 Sobic004G280401--Sobic001G280700 Sobic001G345400 Sobic001G345400 Sobic004G280401--Sobic001G345400 Sobic009G234000 Sobic009G234000 Sobic004G280401--Sobic009G234000 Sobic004G110400 Sobic004G110400 Sobic004G280401--Sobic004G110400 Sobic001G130400 Sobic001G130400 Sobic004G280401--Sobic001G130400 Sobic003G277500 Sobic003G277500 Sobic004G280401--Sobic003G277500 Sobic004G333300 Sobic004G333300 Sobic004G280401--Sobic004G333300 Sobic009G131100 Sobic009G131100 Sobic010G171501--Sobic009G131100 Sobic001G536500 Sobic001G536500 Sobic010G171501--Sobic001G536500 Sobic005G127100 Sobic005G127100 Sobic010G171501--Sobic005G127100 Sobic003G003000 Sobic003G003000 Sobic010G171501--Sobic003G003000 Sobic001G198200 Sobic001G198200 Sobic010G171501--Sobic001G198200 Sobic004G311300 Sobic004G311300 Sobic010G171501--Sobic004G311300 Sobic006G108600 Sobic006G108600 Sobic010G171501--Sobic006G108600 Sobic005G080200 Sobic005G080200 Sobic010G171501--Sobic005G080200 Sobic001G081400 Sobic001G081400 Sobic010G171501--Sobic001G081400 Sobic004G063500 Sobic004G063500 Sobic003G325700--Sobic004G063500 Sobic003G146400 Sobic003G146400 Sobic003G325700--Sobic003G146400 Sobic010G196800 Sobic010G196800 Sobic003G325700--Sobic010G196800 Sobic002G113500 Sobic002G113500 Sobic003G325700--Sobic002G113500 Sobic003G063200 Sobic003G063200 Sobic003G325700--Sobic003G063200 Sobic006G158200 Sobic006G158200 Sobic003G325700--Sobic006G158200 Sobic008G111500 Sobic008G111500 Sobic003G325700--Sobic008G111500 Sobic004G247200 Sobic004G247200 Sobic003G325700--Sobic004G247200 Sobic009G131400 Sobic009G131400 Sobic003G325700--Sobic009G131400 Sobic008G113000 Sobic008G113000 Sobic001G280700--Sobic008G113000 Sobic009G154200 Sobic009G154200 Sobic001G280700--Sobic009G154200 Sobic009G232266 Sobic009G232266 Sobic001G280700--Sobic009G232266 Sobic004G117600 Sobic004G117600 Sobic001G280700--Sobic004G117600 Sobic003G041600 Sobic003G041600 Sobic001G280700--Sobic003G041600 Sobic006G143400 Sobic006G143400 Sobic001G280700--Sobic006G143400 Sobic006G217900 Sobic006G217900 Sobic001G280700--Sobic006G217900 Sobic001G091600 Sobic001G091600 Sobic001G280700--Sobic001G091600 Sobic006G100200 Sobic006G100200 Sobic001G280700--Sobic006G100200 Sobic003G296300 Sobic003G296300 Sobic001G345400--Sobic003G296300 Sobic004G101000 Sobic004G101000 Sobic001G345400--Sobic004G101000 Sobic009G038000 Sobic009G038000 Sobic001G345400--Sobic009G038000 Sobic005G155600 Sobic005G155600 Sobic001G345400--Sobic005G155600 Sobic006G246100 Sobic006G246100 Sobic001G345400--Sobic006G246100 Sobic001G345400--Sobic004G333300 Sobic001G530350 Sobic001G530350 Sobic001G345400--Sobic001G530350 Sobic009G192100 Sobic009G192100 Sobic001G345400--Sobic009G192100 Sobic008G038100 Sobic008G038100 Sobic001G345400--Sobic008G038100 Sobic010G175900 Sobic010G175900 Sobic009G234000--Sobic010G175900 Sobic004G306300 Sobic004G306300 Sobic009G234000--Sobic004G306300 Sobic005G028700 Sobic005G028700 Sobic009G234000--Sobic005G028700 Sobic004G259600 Sobic004G259600 Sobic009G234000--Sobic004G259600 Sobic006G100700 Sobic006G100700 Sobic009G234000--Sobic006G100700 Sobic002G202100 Sobic002G202100 Sobic009G234000--Sobic002G202100 Sobic009G234000--Sobic003G063200 Sobic009G234000--Sobic004G247200 Sobic005G168100 Sobic005G168100 Sobic009G234000--Sobic005G168100 Sobic006G167800 Sobic006G167800 Sobic004G110400--Sobic006G167800 Sobic001G314800 Sobic001G314800 Sobic004G110400--Sobic001G314800 Sobic001G526000 Sobic001G526000 Sobic004G110400--Sobic001G526000 Sobic004G110400--Sobic004G333300 Sobic004G110400--Sobic005G155600 Sobic004G110400--Sobic003G296300 Sobic002G376000 Sobic002G376000 Sobic004G110400--Sobic002G376000 Sobic002G269400 Sobic002G269400 Sobic004G110400--Sobic002G269400 Sobic004G110400--Sobic001G345400 Sobic001G130400--Sobic004G063500 Sobic009G120100 Sobic009G120100 Sobic001G130400--Sobic009G120100 Sobic004G137900 Sobic004G137900 Sobic001G130400--Sobic004G137900 Sobic001G066700 Sobic001G066700 Sobic001G130400--Sobic001G066700 Sobic003G358300 Sobic003G358300 Sobic001G130400--Sobic003G358300 Sobic005G111100 Sobic005G111100 Sobic001G130400--Sobic005G111100 Sobic009G070200 Sobic009G070200 Sobic001G130400--Sobic009G070200 Sobic001G130400--Sobic003G325700 Sobic001G434400 Sobic001G434400 Sobic001G130400--Sobic001G434400 Sobic006G044932 Sobic006G044932 Sobic003G277500--Sobic006G044932 Sobic004G010300 Sobic004G010300 Sobic003G277500--Sobic004G010300 Sobic003G162700 Sobic003G162700 Sobic003G277500--Sobic003G162700 Sobic002G070200 Sobic002G070200 Sobic003G277500--Sobic002G070200 Sobic002G407700 Sobic002G407700 Sobic003G277500--Sobic002G407700 Sobic003G277500--Sobic009G232266 Sobic002G373001 Sobic002G373001 Sobic003G277500--Sobic002G373001 Sobic002G333300 Sobic002G333300 Sobic003G277500--Sobic002G333300 Sobic004G195000 Sobic004G195000 Sobic003G277500--Sobic004G195000 Sobic004G333300--Sobic001G345400 Sobic009G216050 Sobic009G216050 Sobic004G333300--Sobic009G216050 Sobic004G209500 Sobic004G209500 Sobic004G333300--Sobic004G209500 Sobic004G333300--Sobic008G038100 Sobic004G174000 Sobic004G174000 Sobic004G333300--Sobic004G174000 Sobic003G310500 Sobic003G310500 Sobic004G333300--Sobic003G310500 Sobic004G333300--Sobic004G110400 Sobic004G333300--Sobic001G314800 Sobic004G333300--Sobic004G101000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.