Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G302100.1
Synonym Sb04g033540
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YSA7
Pfam PF12274
Panther DB PTHR23068 PTHR23068:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G396500 ZOS5-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.001G440000 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
3 Sobic.009G084800 - -
4 Sobic.006G152700 - -
5 Sobic.003G325600 expressed protein -
6 Sobic.001G218600 MATH domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G171001 - -
8 Sobic.003G044000 lipase class 3 family protein, putative, expressed -
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10 Sobic.009G084700 - -
11 Sobic.002G322700 expressed protein -
12 Sobic.001G091701 - -
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14 Sobic.007G141600 ZOS8-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
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16 Sobic.003G090000 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
17 Sobic.008G188800 ankyrin repeat domain-containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G072700 expressed protein -
19 Sobic.003G423700 endonuclease, putative, expressed K08991: crossover junction endonuclease MUS81
20 Sobic.009G168150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G302100 Sobic004G302100 Sobic003G396500 Sobic003G396500 Sobic004G302100--Sobic003G396500 Sobic001G440000 Sobic001G440000 Sobic004G302100--Sobic001G440000 Sobic009G084800 Sobic009G084800 Sobic004G302100--Sobic009G084800 Sobic006G152700 Sobic006G152700 Sobic004G302100--Sobic006G152700 Sobic003G325600 Sobic003G325600 Sobic004G302100--Sobic003G325600 Sobic001G218600 Sobic001G218600 Sobic004G302100--Sobic001G218600 Sobic001G171001 Sobic001G171001 Sobic004G302100--Sobic001G171001 Sobic003G044000 Sobic003G044000 Sobic004G302100--Sobic003G044000 Sobic007G146200 Sobic007G146200 Sobic004G302100--Sobic007G146200 Sobic003G396500--Sobic001G218600 Sobic003G396500--Sobic003G325600 Sobic003G090000 Sobic003G090000 Sobic003G396500--Sobic003G090000 Sobic002G299200 Sobic002G299200 Sobic003G396500--Sobic002G299200 Sobic003G027000 Sobic003G027000 Sobic003G396500--Sobic003G027000 Sobic006G215800 Sobic006G215800 Sobic003G396500--Sobic006G215800 Sobic003G396500--Sobic006G152700 Sobic005G070301 Sobic005G070301 Sobic003G396500--Sobic005G070301 Sobic004G313400 Sobic004G313400 Sobic003G396500--Sobic004G313400 Sobic002G239400 Sobic002G239400 Sobic001G440000--Sobic002G239400 Sobic010G153400 Sobic010G153400 Sobic001G440000--Sobic010G153400 Sobic009G066200 Sobic009G066200 Sobic001G440000--Sobic009G066200 Sobic004G298600 Sobic004G298600 Sobic001G440000--Sobic004G298600 Sobic001G131900 Sobic001G131900 Sobic001G440000--Sobic001G131900 Sobic003G435300 Sobic003G435300 Sobic001G440000--Sobic003G435300 Sobic004G213400 Sobic004G213400 Sobic001G440000--Sobic004G213400 Sobic001G091701 Sobic001G091701 Sobic001G440000--Sobic001G091701 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic001G440000--Sobic002G392400 Sobic009G084700 Sobic009G084700 Sobic009G084800--Sobic009G084700 Sobic009G084800--Sobic004G313400 Sobic009G084800--Sobic001G131900 Sobic002G151500 Sobic002G151500 Sobic009G084800--Sobic002G151500 Sobic002G322700 Sobic002G322700 Sobic009G084800--Sobic002G322700 Sobic008G140600 Sobic008G140600 Sobic009G084800--Sobic008G140600 Sobic009G084800--Sobic003G396500 Sobic007G141600 Sobic007G141600 Sobic009G084800--Sobic007G141600 Sobic009G066600 Sobic009G066600 Sobic009G084800--Sobic009G066600 Sobic007G012600 Sobic007G012600 Sobic006G152700--Sobic007G012600 Sobic003G072700 Sobic003G072700 Sobic006G152700--Sobic003G072700 Sobic006G152700--Sobic003G396500 Sobic003G377300 Sobic003G377300 Sobic006G152700--Sobic003G377300 Sobic008G188800 Sobic008G188800 Sobic006G152700--Sobic008G188800 Sobic006G152700--Sobic008G140600 Sobic009G142500 Sobic009G142500 Sobic006G152700--Sobic009G142500 Sobic006G152700--Sobic007G146200 Sobic003G258100 Sobic003G258100 Sobic006G152700--Sobic003G258100 Sobic003G325600--Sobic003G396500 Sobic008G024100 Sobic008G024100 Sobic003G325600--Sobic008G024100 Sobic003G325600--Sobic001G218600 Sobic001G506400 Sobic001G506400 Sobic003G325600--Sobic001G506400 Sobic001G135700 Sobic001G135700 Sobic003G325600--Sobic001G135700 Sobic007G063800 Sobic007G063800 Sobic003G325600--Sobic007G063800 Sobic008G082000 Sobic008G082000 Sobic003G325600--Sobic008G082000 Sobic004G062600 Sobic004G062600 Sobic003G325600--Sobic004G062600 Sobic004G033400 Sobic004G033400 Sobic003G325600--Sobic004G033400 Sobic001G218600--Sobic003G090000 Sobic001G218600--Sobic003G027000 Sobic001G218600--Sobic003G396500 Sobic001G218600--Sobic005G070301 Sobic001G218600--Sobic001G506400 Sobic001G218600--Sobic003G044000 Sobic007G060100 Sobic007G060100 Sobic001G218600--Sobic007G060100 Sobic010G157200 Sobic010G157200 Sobic001G218600--Sobic010G157200 Sobic010G263400 Sobic010G263400 Sobic001G218600--Sobic010G263400 Sobic001G171001--Sobic003G396500 Sobic001G171001--Sobic007G012600 Sobic001G171001--Sobic006G152700 Sobic001G171001--Sobic003G325600 Sobic001G171001--Sobic002G299200 Sobic001G288000 Sobic001G288000 Sobic001G171001--Sobic001G288000 Sobic010G030000 Sobic010G030000 Sobic001G171001--Sobic010G030000 Sobic009G136000 Sobic009G136000 Sobic001G171001--Sobic009G136000 Sobic001G171001--Sobic004G302100 Sobic003G044000--Sobic001G218600 Sobic003G044000--Sobic003G090000 Sobic003G044000--Sobic003G027000 Sobic003G044000--Sobic001G506400 Sobic003G044000--Sobic001G131900 Sobic003G044000--Sobic003G396500 Sobic003G044000--Sobic009G066600 Sobic003G044000--Sobic004G313400 Sobic003G293400 Sobic003G293400 Sobic003G044000--Sobic003G293400 Sobic007G146200--Sobic002G322700 Sobic007G146200--Sobic008G188800 Sobic007G146200--Sobic003G072700 Sobic010G009700 Sobic010G009700 Sobic007G146200--Sobic010G009700 Sobic009G125800 Sobic009G125800 Sobic007G146200--Sobic009G125800 Sobic007G146200--Sobic006G152700 Sobic005G045800 Sobic005G045800 Sobic007G146200--Sobic005G045800 Sobic007G146200--Sobic007G141600 Sobic007G146200--Sobic008G140600
Octagon: transcription factors


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