Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G003500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPG4
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cDNA sequences
Sobic.005G003500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G256900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
2 Sobic.008G157200 inorganic H+ pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
3 Sobic.001G275300 - K10899: ATP-dependent DNA helicase Q1
4 Sobic.003G355900 prenylated rab acceptor, putative, expressed -
5 Sobic.006G127600 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed K09597: signal peptide peptidase-like 2B
6 Sobic.003G110000 TBC domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G493700 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G013300 expressed protein -
9 Sobic.006G184900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K15176: RNA polymerase-associated protein CTR9
10 Sobic.009G255700 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
11 Sobic.009G131300 cation-transporting ATPase, putative, expressed K14950: ATP13A1, manganese-transporting P-type ATPase
12 Sobic.003G311900 CK1_CaseinKinase_1a.3 - CK1 includes the casein kinase 1 kinases, expressed -
13 Sobic.002G275700 pantothenate kinase, putative, expressed K09680: type II pantothenate kinase
14 Sobic.003G166750 - K15188: cyclin T
15 Sobic.003G264100 - K10843: ERCC3, DNA excision repair protein ERCC-3
16 Sobic.002G335600 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
17 Sobic.002G429300 importin subunit beta, putative, expressed -
18 Sobic.001G192000 autophagy protein 9, putative, expressed K17907: autophagy-related protein 9
19 Sobic.003G241700 SET domain containing protein, expressed -
20 Sobic.008G185800 translation initiation factor IF-3, putative, expressed K02520: infC, translation initiation factor IF-3


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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