Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G030850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHM2
Pfam PF01535 PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G65560 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35436.1 : Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G045000 expressed protein -
2 Sobic.010G114900 expressed protein -
3 Sobic.010G227000 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.007G168300 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY, putative, expressed -
5 Sobic.010G236200 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G125000 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
7 Sobic.009G099100 rust-resistance protein Lr21, putative, expressed -
8 Sobic.007G155500 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G342300 expressed protein -
10 Sobic.007G051700 lissencephaly type-1-like homology motif, putative, expressed -
11 Sobic.010G080550 - -
12 Sobic.001G245900 expressed protein -
13 Sobic.003G431600 expressed protein -
14 Sobic.006G059500 expressed protein K13150: COIL, coilin
15 Sobic.006G179300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G164200 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
17 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G150900 growth regulating factor protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G286200 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G132000 RGH1A, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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