Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G059100.1
Synonym NPX1, Sb05g004810
Functional annotation bromodomain domain containing protein, expressed
UniProt C5Y629
Pfam PF00439
Panther DB PTHR22880 PTHR22880:SF151
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46550 : DNA-binding bromodomain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32420.1 : bromodomain domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012846 , Zm00025a033989
Brachypodium KQK07364
Barley -
Wheat TraesCS7B02G461100 , TraesCS7B02G461100 , TraesCS7B02G461100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G059100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G043500 DNA topoisomerase 1, putative, expressed K03163: DNA topoisomerase I
2 Sobic.007G026000 ATBET9, putative, expressed -
3 Sobic.006G123900 chloroplastic group IIA intron splicing facilitator CRS1, chloroplast precursor, putative, expressed -
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8 Sobic.001G206100 expressed protein -
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10 Sobic.004G213000 AT hook motif family protein, expressed -
11 Sobic.004G031700 expressed protein -
12 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
13 Sobic.002G313300 bromodomain domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G405300 6PF-2-K/Fru-2,6-P2ASE liver isozyme, putative, expressed -
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17 Sobic.008G073000 expressed protein -
18 Sobic.006G046700 vacuolar protein sorting-associated protein 11, putative, expressed -
19 Sobic.002G001600 MBTB12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.007G000100 PWWP domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G059100 Sobic005G059100 Sobic007G043500 Sobic007G043500 Sobic005G059100--Sobic007G043500 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic005G059100--Sobic007G026000 Sobic006G123900 Sobic006G123900 Sobic005G059100--Sobic006G123900 Sobic002G067800 Sobic002G067800 Sobic005G059100--Sobic002G067800 Sobic010G194700 Sobic010G194700 Sobic005G059100--Sobic010G194700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic005G059100--Sobic006G080300 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic005G059100--Sobic007G185900 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic005G059100--Sobic001G206100 Sobic002G159200 Sobic002G159200 Sobic005G059100--Sobic002G159200 Sobic007G043500--Sobic005G059100 Sobic007G043500--Sobic002G159200 Sobic007G043500--Sobic006G123900 Sobic007G043500--Sobic002G067800 Sobic007G043500--Sobic010G194700 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic007G043500--Sobic001G405300 Sobic008G073000 Sobic008G073000 Sobic007G043500--Sobic008G073000 Sobic007G043500--Sobic006G080300 Sobic008G106000 Sobic008G106000 Sobic007G043500--Sobic008G106000 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic007G026000--Sobic008G153000 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic007G026000--Sobic006G046700 Sobic007G026000--Sobic005G059100 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic007G026000--Sobic003G445400 Sobic009G119000 Sobic009G119000 Sobic007G026000--Sobic009G119000 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic007G026000--Sobic002G153700 Sobic007G026000--Sobic001G206100 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic007G026000--Sobic006G013500 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic007G026000--Sobic004G031700 Sobic006G123900--Sobic008G106000 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic006G123900--Sobic002G001600 Sobic006G123900--Sobic005G059100 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G123900--Sobic002G313300 Sobic006G123900--Sobic006G013500 Sobic008G129700 Sobic008G129700 Sobic006G123900--Sobic008G129700 Sobic006G123900--Sobic006G080300 Sobic006G123900--Sobic007G185900 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic006G123900--Sobic002G151600 Sobic002G067800--Sobic010G194700 Sobic008G165100 Sobic008G165100 Sobic002G067800--Sobic008G165100 Sobic002G067800--Sobic005G059100 Sobic002G095700 Sobic002G095700 Sobic002G067800--Sobic002G095700 Sobic002G067800--Sobic008G073000 Sobic002G067800--Sobic002G159200 Sobic003G355000 Sobic003G355000 Sobic002G067800--Sobic003G355000 Sobic002G067800--Sobic007G043500 Sobic002G067800--Sobic006G123900 Sobic010G194700--Sobic002G067800 Sobic010G194700--Sobic001G206100 Sobic010G194700--Sobic008G165100 Sobic010G194700--Sobic002G151600 Sobic004G213000 Sobic004G213000 Sobic010G194700--Sobic004G213000 Sobic010G194700--Sobic005G059100 Sobic010G194700--Sobic006G013500 Sobic005G079800 Sobic005G079800 Sobic010G194700--Sobic005G079800 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic010G194700--Sobic003G197800 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G080300--Sobic003G268300 Sobic006G080300--Sobic004G031700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G080300--Sobic001G094000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G080300--Sobic001G477800 Sobic006G080300--Sobic002G313300 Sobic006G080300--Sobic001G206100 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G080300--Sobic002G157000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic006G080300--Sobic003G170100 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G080300--Sobic001G257300 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic007G185900--Sobic004G196700 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G185900--Sobic002G157300 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic007G185900--Sobic007G078000 Sobic010G260500 Sobic010G260500 Sobic007G185900--Sobic010G260500 Sobic007G185900--Sobic002G313300 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic007G185900--Sobic008G054500 Sobic003G397800 Sobic003G397800 Sobic007G185900--Sobic003G397800 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic007G185900--Sobic005G149500 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic007G185900--Sobic003G187400 Sobic001G206100--Sobic001G257300 Sobic001G206100--Sobic006G013500 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic006G080300 Sobic001G206100--Sobic002G157000 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic001G206100--Sobic009G000500 Sobic001G206100--Sobic004G213000 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic001G206100--Sobic001G356500 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G206100--Sobic002G161000 Sobic002G159200--Sobic007G043500 Sobic002G159200--Sobic009G000500 Sobic002G159200--Sobic002G067800 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic002G159200--Sobic003G307000 Sobic002G159200--Sobic005G059100 Sobic002G159200--Sobic001G405300 Sobic002G159200--Sobic006G046700 Sobic002G159200--Sobic003G355000 Sobic002G159200--Sobic007G026000
Octagon: transcription factors


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