Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G027000.2,Sobic.006G027000.1
Synonym Sb06g002621
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YCS8 , A0A1Z5RBQ8
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08650.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G027000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G171700 - -
2 Sobic.007G097900 OsFBL45 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
3 Sobic.003G162000 - K00878: hydroxyethylthiazole kinase
4 Sobic.002G134600 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G290100 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
6 Sobic.001G541100 signal recognition particle receptor, putative, expressed K13431: signal recognition particle receptor subunit alpha
7 Sobic.002G418700 expressed protein -
8 Sobic.006G119800 leucine rich repeat containing protein, expressed -
9 Sobic.001G387600 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
10 Sobic.001G031600 calmodulin binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G130800 transporter family protein, putative, expressed K08150: SLC2A13, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (myo-inositol transporter), member 13
12 Sobic.001G395400 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10578: UBE2J1, NCUBE1, ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1
13 Sobic.007G019800 expressed protein -
14 Sobic.001G138300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
15 Sobic.010G267500 bZIP orthologous(PubMedID : 28671251)@E2F-related protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G156000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.004G028000 expressed protein -
18 Sobic.003G105101 - K13628: iron-sulfur cluster assembly protein
19 Sobic.010G265300 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G400200 CS domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G027000 Sobic006G027000 Sobic006G171700 Sobic006G171700 Sobic006G027000--Sobic006G171700 Sobic007G097900 Sobic007G097900 Sobic006G027000--Sobic007G097900 Sobic003G162000 Sobic003G162000 Sobic006G027000--Sobic003G162000 Sobic002G134600 Sobic002G134600 Sobic006G027000--Sobic002G134600 Sobic003G290100 Sobic003G290100 Sobic006G027000--Sobic003G290100 Sobic001G541100 Sobic001G541100 Sobic006G027000--Sobic001G541100 Sobic002G418700 Sobic002G418700 Sobic006G027000--Sobic002G418700 Sobic006G119800 Sobic006G119800 Sobic006G027000--Sobic006G119800 Sobic001G387600 Sobic001G387600 Sobic006G027000--Sobic001G387600 Sobic004G227300 Sobic004G227300 Sobic006G171700--Sobic004G227300 Sobic003G123000 Sobic003G123000 Sobic006G171700--Sobic003G123000 Sobic002G122600 Sobic002G122600 Sobic006G171700--Sobic002G122600 Sobic008G165700 Sobic008G165700 Sobic006G171700--Sobic008G165700 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic006G171700--Sobic010G280100 Sobic001G429300 Sobic001G429300 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Octagon: transcription factors


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