Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G243500.1
Synonym CYL1, NAGLU
Functional annotation alpha-N-acetylglucosaminidase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PNH0
Pfam PF12971 PF12972 PF05089
Panther DB PTHR12872 PTHR12872:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01205; alpha-N-acetylglucosaminidase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13690 : alpha-N-acetylglucosaminidase family / NAGLU family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55730.1 : alpha-N-acetylglucosaminidase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009507
Brachypodium KQJ84999
Barley HORVU2Hr1G113190.30 , HORVU2Hr1G113190.28 , HORVU2Hr1G113190.29 , HORVU2Hr1G113190.25 , HORVU2Hr1G113190.26 , HORVU2Hr1G113190.27 , HORVU2Hr1G113190.20 , HORVU2Hr1G113190.21 , HORVU2Hr1G113190.22 , HORVU2Hr1G113190.11 , HORVU2Hr1G113190.10 , HORVU2Hr1G113190.13 , HORVU2Hr1G113190.12 , HORVU2Hr1G113190.15 , HORVU2Hr1G113190.14 , HORVU2Hr1G113190.17 , HORVU2Hr1G113190.16 , HORVU2Hr1G113190.19 , HORVU2Hr1G113190.18 , HORVU2Hr1G113190.5 , HORVU2Hr1G113190.4 , HORVU2Hr1G113190.7 , HORVU2Hr1G113190.6 , HORVU2Hr1G113190.1 , HORVU2Hr1G113190.3 , HORVU2Hr1G113190.2 , HORVU2Hr1G113190.9 , HORVU2Hr1G113190.8 , HORVU2Hr1G113190.31
Wheat TraesCS2B02G537300 , TraesCS2A02G508800 , TraesCS2D02G510600
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.006G243500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G079700 metal cation transporter, putative, expressed K07238: TC.ZIP, zupT, ZRT3, zinc transporter, ZIP family
2 Sobic.009G246700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.004G161900 AMP-binding enzyme, putative, expressed K01895: ACSS1_2, acetyl-CoA synthetase
4 Sobic.003G045600 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G100800 initiation factor 2 subunit family domain containing protein, expressed K08963: methylthioribose-1-phosphate isomerase
6 Sobic.001G460400 expressed protein -
7 Sobic.006G000600 expressed protein -
8 Sobic.007G193200 MTA/SAH nucleosidase, putative, expressed K01244: 5'-methylthioadenosine nucleosidase
9 Sobic.002G408800 protein kinase family protein, putative, expressed K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
10 Sobic.001G365200 aminotransferase domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G172200 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G306700 expressed protein -
13 Sobic.001G072600 expressed protein -
14 Sobic.004G261500 phosphoribosyl transferase, putative, expressed -
15 Sobic.001G144200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF581 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G119500 expressed protein -
17 Sobic.002G153100 "bZIP, coexpress with genes associated with the hormonesignaling pathway, anther develop-ment in Arabidopsis"(PubMedID : 28944535)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
18 Sobic.010G216000 villin protein, putative, expressed K05768: gelsolin
19 Sobic.004G339800 phosphate transporter 1, putative, expressed -
20 Sobic.003G368000 OsFBT3 - F-box and tubby domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G243500 Sobic006G243500 Sobic004G079700 Sobic004G079700 Sobic006G243500--Sobic004G079700 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic006G243500--Sobic009G246700 Sobic004G161900 Sobic004G161900 Sobic006G243500--Sobic004G161900 Sobic003G045600 Sobic003G045600 Sobic006G243500--Sobic003G045600 Sobic005G100800 Sobic005G100800 Sobic006G243500--Sobic005G100800 Sobic001G460400 Sobic001G460400 Sobic006G243500--Sobic001G460400 Sobic006G000600 Sobic006G000600 Sobic006G243500--Sobic006G000600 Sobic007G193200 Sobic007G193200 Sobic006G243500--Sobic007G193200 Sobic002G408800 Sobic002G408800 Sobic006G243500--Sobic002G408800 Sobic004G079700--Sobic006G243500 Sobic002G306700 Sobic002G306700 Sobic004G079700--Sobic002G306700 Sobic004G079700--Sobic004G161900 Sobic003G368000 Sobic003G368000 Sobic004G079700--Sobic003G368000 Sobic004G261500 Sobic004G261500 Sobic004G079700--Sobic004G261500 Sobic001G443100 Sobic001G443100 Sobic004G079700--Sobic001G443100 Sobic004G079700--Sobic007G193200 Sobic004G079700--Sobic005G100800 Sobic005G033000 Sobic005G033000 Sobic004G079700--Sobic005G033000 Sobic001G133900 Sobic001G133900 Sobic009G246700--Sobic001G133900 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic009G246700--Sobic009G026101 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic009G246700--Sobic001G406700 Sobic007G119500 Sobic007G119500 Sobic009G246700--Sobic007G119500 Sobic001G072600 Sobic001G072600 Sobic009G246700--Sobic001G072600 Sobic002G167600 Sobic002G167600 Sobic009G246700--Sobic002G167600 Sobic001G360700 Sobic001G360700 Sobic009G246700--Sobic001G360700 Sobic009G246700--Sobic001G460400 Sobic006G144600 Sobic006G144600 Sobic009G246700--Sobic006G144600 Sobic004G161900--Sobic003G368000 Sobic003G017601 Sobic003G017601 Sobic004G161900--Sobic003G017601 Sobic010G045400 Sobic010G045400 Sobic004G161900--Sobic010G045400 Sobic008G037900 Sobic008G037900 Sobic004G161900--Sobic008G037900 Sobic004G161900--Sobic001G460400 Sobic001G218500 Sobic001G218500 Sobic004G161900--Sobic001G218500 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic004G161900--Sobic003G079100 Sobic002G383900 Sobic002G383900 Sobic004G161900--Sobic002G383900 Sobic003G020500 Sobic003G020500 Sobic004G161900--Sobic003G020500 Sobic006G259401 Sobic006G259401 Sobic003G045600--Sobic006G259401 Sobic003G236800 Sobic003G236800 Sobic003G045600--Sobic003G236800 Sobic002G101300 Sobic002G101300 Sobic003G045600--Sobic002G101300 Sobic003G045600--Sobic004G079700 Sobic002G153100 Sobic002G153100 Sobic003G045600--Sobic002G153100 Sobic001G140000 Sobic001G140000 Sobic003G045600--Sobic001G140000 Sobic007G119800 Sobic007G119800 Sobic003G045600--Sobic007G119800 Sobic002G274600 Sobic002G274600 Sobic003G045600--Sobic002G274600 Sobic008G151500 Sobic008G151500 Sobic003G045600--Sobic008G151500 Sobic005G100800--Sobic007G193200 Sobic005G110541 Sobic005G110541 Sobic005G100800--Sobic005G110541 Sobic005G100800--Sobic004G261500 Sobic008G109400 Sobic008G109400 Sobic005G100800--Sobic008G109400 Sobic001G271300 Sobic001G271300 Sobic005G100800--Sobic001G271300 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic005G100800--Sobic001G395900 Sobic003G154500 Sobic003G154500 Sobic005G100800--Sobic003G154500 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic005G100800--Sobic006G230200 Sobic002G041100 Sobic002G041100 Sobic005G100800--Sobic002G041100 Sobic001G460400--Sobic001G360700 Sobic001G067800 Sobic001G067800 Sobic001G460400--Sobic001G067800 Sobic001G460400--Sobic004G161900 Sobic001G460400--Sobic003G017601 Sobic002G207200 Sobic002G207200 Sobic001G460400--Sobic002G207200 Sobic001G227850 Sobic001G227850 Sobic001G460400--Sobic001G227850 Sobic001G460400--Sobic009G246700 Sobic001G460400--Sobic008G037900 Sobic010G218300 Sobic010G218300 Sobic001G460400--Sobic010G218300 Sobic006G000600--Sobic004G161900 Sobic009G033100 Sobic009G033100 Sobic006G000600--Sobic009G033100 Sobic006G177300 Sobic006G177300 Sobic006G000600--Sobic006G177300 Sobic001G365200 Sobic001G365200 Sobic006G000600--Sobic001G365200 Sobic006G000600--Sobic003G368000 Sobic005G134600 Sobic005G134600 Sobic006G000600--Sobic005G134600 Sobic004G323900 Sobic004G323900 Sobic006G000600--Sobic004G323900 Sobic006G000600--Sobic005G110541 Sobic006G000600--Sobic006G243500 Sobic007G193200--Sobic004G261500 Sobic004G079900 Sobic004G079900 Sobic007G193200--Sobic004G079900 Sobic001G181600 Sobic001G181600 Sobic007G193200--Sobic001G181600 Sobic007G193200--Sobic003G154500 Sobic001G218400 Sobic001G218400 Sobic007G193200--Sobic001G218400 Sobic007G193200--Sobic005G033000 Sobic001G454900 Sobic001G454900 Sobic007G193200--Sobic001G454900 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic007G193200--Sobic005G119900 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic007G193200--Sobic003G441800 Sobic007G120800 Sobic007G120800 Sobic002G408800--Sobic007G120800 Sobic003G029600 Sobic003G029600 Sobic002G408800--Sobic003G029600 Sobic002G029300 Sobic002G029300 Sobic002G408800--Sobic002G029300 Sobic009G049400 Sobic009G049400 Sobic002G408800--Sobic009G049400 Sobic005G074100 Sobic005G074100 Sobic002G408800--Sobic005G074100 Sobic001G322000 Sobic001G322000 Sobic002G408800--Sobic001G322000 Sobic006G056200 Sobic006G056200 Sobic002G408800--Sobic006G056200 Sobic009G231700 Sobic009G231700 Sobic002G408800--Sobic009G231700 Sobic010G216000 Sobic010G216000 Sobic002G408800--Sobic010G216000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.