Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G268600.1
Synonym
Functional annotation SAR DNA-binding protein-like, putative, expressed
UniProt A0A1B6PP51
Pfam -
Panther DB PTHR10894 PTHR10894:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g30790.1 : SAR DNA-binding protein-like, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK17650
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G110000 TBC domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G430000 expressed protein K08518: STXBP5, syntaxin-binding protein 5
3 Sobic.004G005100 peptidase family C78 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G016700 ion channel DMI1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -
5 Sobic.003G186000 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G334300 ATMAK10, putative, expressed -
7 Sobic.004G131040 - K03544: clpX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX
8 Sobic.008G018900 protein of unknown function, DUF618 domain containing protein, expressed K15559: regulator of Ty1 transposition protein 103
9 Sobic.004G277200 GPI transamidase subunit PIG-U domain containing protein, expressed K05293: GPI-anchor transamidase subunit U
10 Sobic.001G105700 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G089800 expressed protein -
12 Sobic.001G004400 - K14290: XPO1, exportin-1
13 Sobic.010G205600 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.002G142900 immunoglobulin/major histocompatibility complex, putative, expressed K12607: CCR4-NOT transcription complex subunit 10
15 Sobic.009G255700 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
16 Sobic.005G122700 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G088872 - -
18 Sobic.006G040500 phospholipid-transporting ATPase 2, putative, expressed K01530: phospholipid-translocating ATPase
19 Sobic.002G133300 ZOS9-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
20 Sobic.002G275700 pantothenate kinase, putative, expressed K09680: type II pantothenate kinase


Gene co-expression network
sample Sobic006G268600 Sobic006G268600 Sobic003G110000 Sobic003G110000 Sobic006G268600--Sobic003G110000 Sobic002G430000 Sobic002G430000 Sobic006G268600--Sobic002G430000 Sobic004G005100 Sobic004G005100 Sobic006G268600--Sobic004G005100 Sobic001G016700 Sobic001G016700 Sobic006G268600--Sobic001G016700 Sobic003G186000 Sobic003G186000 Sobic006G268600--Sobic003G186000 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic006G268600--Sobic004G334300 Sobic004G131040 Sobic004G131040 Sobic006G268600--Sobic004G131040 Sobic008G018900 Sobic008G018900 Sobic006G268600--Sobic008G018900 Sobic004G277200 Sobic004G277200 Sobic006G268600--Sobic004G277200 Sobic008G098900 Sobic008G098900 Sobic003G110000--Sobic008G098900 Sobic001G085300 Sobic001G085300 Sobic003G110000--Sobic001G085300 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic003G110000--Sobic003G166750 Sobic002G275700 Sobic002G275700 Sobic003G110000--Sobic002G275700 Sobic003G110000--Sobic002G430000 Sobic001G194200 Sobic001G194200 Sobic003G110000--Sobic001G194200 Sobic001G370900 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Octagon: transcription factors


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