Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G131040.1,Sobic.004G131040.3,Sobic.004G131040.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A194YPE6 , A0A1Z5RMD6 , A0A194YPE7
Pfam PF00004 PF10431 PF10431 PF07724 PF00004
Panther DB PTHR11262 PTHR11262:SF11
NCBI CDD KOG0745; Putative ATP-dependent Clp-type protease (AAA+ ATPase superfamily)
KEGG Orthology K03544; clpX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53350 : CLP protease regulatory subunit X
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g19150.1 : AAA family ATPase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019748
Brachypodium KQJ94461 , KQK10950 , KQK10951
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G000600 BBF1 - 2 Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domains with a F5/8 type C discoidin domain, expressed -
2 Sobic.004G265800 uridine kinase, putative, expressed -
3 Sobic.002G181300 expressed protein -
4 Sobic.001G146800 expressed protein -
5 Sobic.002G315800 Papain family cysteine protease domain containing protein, expressed K01363: cathepsin B
6 Sobic.006G030600 xa21, putative, expressed -
7 Sobic.007G004500 phosphatidylinositol-4-phosphate 5-Kinase, putative, expressed K00921: PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase
8 Sobic.002G193100 expressed protein -
9 Sobic.003G110000 TBC domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G193500 AGAP007115-PA, putative, expressed -
11 Sobic.010G224000 molybdenum cofactor sulfurase, putative, expressed K15631: molybdenum cofactor sulfurtransferase
12 Sobic.002G159700 - -
13 Sobic.004G065000 expressed protein -
14 Sobic.002G339300 myosin-Vb, putative, expressed K10357: myosin V
15 Sobic.006G043600 cysteine proteinase 1 precursor, putative, expressed K01373: cathepsin F
16 Sobic.002G276100 OsLonP4 - Putative Lon protease homologue, expressed K01338: ATP-dependent Lon protease
17 Sobic.007G103100 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
18 Sobic.001G252000 uridylyltransferase-related, putative, expressed -
19 Sobic.002G217200 oryzain gamma chain precursor, putative, expressed K01366: cathepsin H
20 Sobic.004G262700 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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