Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G128500.1
Synonym Sb07g020490
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKY6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32420.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031047
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G128500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G152800 Cellular calcium signals(PubMedID : 19860013)@calcineurin B, putative, expressed K06268: PPP3R, serine/threonine-protein phosphatase 2B regulatory subunit
2 Sobic.003G071000 SLT1 protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G186000 salt tolerant protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G123000 splicing factor 3 subunit 1, putative, expressed K12825: SF3A1, splicing factor 3A subunit 1
5 Sobic.007G041300 expressed protein -
6 Sobic.004G285400 ZOS2-15 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
7 Sobic.006G051900 expressed protein -
8 Sobic.001G473600 ZOS5-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.004G237100 AP2/EREBP transcription factor BABY BOOM, putative, expressed -
10 Sobic.010G082700 expressed protein -
11 Sobic.010G021200 GAGA-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G218800 expressed protein -
13 Sobic.007G102700 - -
14 Sobic.010G237900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G171100 RNA recognition motif containing protein, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
16 Sobic.003G122500 RNA binding protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
17 Sobic.009G070100 expressed protein -
18 Sobic.005G160400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K19043: E3 ubiquitin-protein ligase RHF
19 Sobic.001G222900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
20 Sobic.008G088200 DnaK family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G128500 Sobic007G128500 Sobic008G152800 Sobic008G152800 Sobic007G128500--Sobic008G152800 Sobic003G071000 Sobic003G071000 Sobic007G128500--Sobic003G071000 Sobic004G186000 Sobic004G186000 Sobic007G128500--Sobic004G186000 Sobic003G123000 Sobic003G123000 Sobic007G128500--Sobic003G123000 Sobic007G041300 Sobic007G041300 Sobic007G128500--Sobic007G041300 Sobic004G285400 Sobic004G285400 Sobic007G128500--Sobic004G285400 Sobic006G051900 Sobic006G051900 Sobic007G128500--Sobic006G051900 Sobic001G473600 Sobic001G473600 Sobic007G128500--Sobic001G473600 Sobic004G237100 Sobic004G237100 Sobic007G128500--Sobic004G237100 Sobic001G178600 Sobic001G178600 Sobic008G152800--Sobic001G178600 Sobic001G039600 Sobic001G039600 Sobic008G152800--Sobic001G039600 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic008G152800--Sobic006G133800 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic008G152800--Sobic009G000500 Sobic008G152800--Sobic001G473600 Sobic002G277600 Sobic002G277600 Sobic008G152800--Sobic002G277600 Sobic008G124700 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Octagon: transcription factors


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