Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G029500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PBS9
Pfam PF10275
Panther DB PTHR12931 PTHR12931:SF18
NCBI CDD KOG3991; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28120 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053807 , Zm00025a053809
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.001G206100 expressed protein -
3 Sobic.001G251700 OsPP2Ac-4 - Phosphatase 2A isoform 4 belonging to family 2, expressed K04382: serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit
4 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
6 Sobic.002G243900 - -
7 Sobic.002G320500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
8 Sobic.006G046700 vacuolar protein sorting-associated protein 11, putative, expressed -
9 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
10 Sobic.002G357700 phospholipid-transporting ATPase 2, putative, expressed K01530: phospholipid-translocating ATPase
11 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
12 Sobic.004G271000 expressed protein -
13 Sobic.001G395500 SET domain containing protein, expressed K11430: [histone H3]-lysine27 N-trimethyltransferase EZH2
14 Sobic.001G152320 - -
15 Sobic.002G145101 - -
16 Sobic.001G347300 splicing factor, arginine/serine-rich 16, putative, expressed K13168: splicing factor, arginine/serine-rich 16
17 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G032400 expressed protein -
19 Sobic.007G000100 PWWP domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G092033 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G029500 Sobic008G029500 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic008G029500--Sobic001G257300 Sobic001G206100 Sobic001G206100 Sobic008G029500--Sobic001G206100 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic008G029500--Sobic001G251700 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic008G029500--Sobic005G013200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic008G029500--Sobic003G200200 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic008G029500--Sobic002G243900 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic008G029500--Sobic002G320500 Sobic006G046700 Sobic006G046700 Sobic008G029500--Sobic006G046700 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic008G029500--Sobic002G157000 Sobic001G257300--Sobic001G206100 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G257300--Sobic006G013500 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G257300--Sobic003G170100 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G257300--Sobic006G080300 Sobic001G257300--Sobic003G200200 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic001G257300--Sobic002G001600 Sobic004G213000 Sobic004G213000 Sobic001G257300--Sobic004G213000 Sobic002G161000 Sobic002G161000 Sobic001G257300--Sobic002G161000 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic001G257300--Sobic001G162300 Sobic001G206100--Sobic001G257300 Sobic001G206100--Sobic006G013500 Sobic001G206100--Sobic002G320500 Sobic001G206100--Sobic006G080300 Sobic001G206100--Sobic002G157000 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic001G206100--Sobic009G000500 Sobic001G206100--Sobic004G213000 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic001G206100--Sobic001G356500 Sobic001G206100--Sobic002G161000 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic001G251700--Sobic007G137900 Sobic001G251700--Sobic003G200200 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic001G251700--Sobic002G157300 Sobic001G251700--Sobic002G157000 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G251700--Sobic006G082600 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic001G251700--Sobic002G248400 Sobic001G251700--Sobic002G320500 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G251700--Sobic003G268300 Sobic003G220200 Sobic003G220200 Sobic001G251700--Sobic003G220200 Sobic002G103600 Sobic002G103600 Sobic005G013200--Sobic002G103600 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic005G013200--Sobic010G129200 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic005G013200--Sobic008G162900 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic005G013200--Sobic001G407200 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic005G013200--Sobic001G222500 Sobic002G408200 Sobic002G408200 Sobic005G013200--Sobic002G408200 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic005G013200--Sobic008G028700 Sobic005G013200--Sobic001G251700 Sobic004G084300 Sobic004G084300 Sobic005G013200--Sobic004G084300 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic002G320500--Sobic002G157000 Sobic002G320500--Sobic002G248400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G320500--Sobic009G065100 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic002G320500--Sobic009G210500 Sobic006G133800 Sobic006G133800 Sobic002G320500--Sobic006G133800 Sobic001G107500 Sobic001G107500 Sobic002G320500--Sobic001G107500 Sobic006G032400 Sobic006G032400 Sobic002G320500--Sobic006G032400 Sobic002G320500--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic002G320500--Sobic001G090400 Sobic008G153000 Sobic008G153000 Sobic006G046700--Sobic008G153000 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G046700--Sobic004G031700 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G046700--Sobic007G026000 Sobic006G046700--Sobic001G206100 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic006G046700--Sobic001G306900 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G046700--Sobic003G445400 Sobic001G425000 Sobic001G425000 Sobic006G046700--Sobic001G425000 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic006G046700--Sobic001G405300 Sobic006G046700--Sobic006G013500 Sobic002G157000--Sobic002G248400 Sobic002G157000--Sobic002G320500 Sobic002G157000--Sobic003G200200 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic002G157000--Sobic001G420200 Sobic002G157000--Sobic008G173900 Sobic002G157000--Sobic003G268300 Sobic002G157000--Sobic001G162300 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic002G157000--Sobic003G108700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G157000--Sobic001G094000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.