Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G035501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5H8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G33480 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05300.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053873
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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1 Sobic.004G260800 Fatty acid desaturase 2 (omega-6 fatty acid desaturase) FAD2 (Os)(PubMedID : 27208977)@Fatty acid desaturase 2 (omega-6 fatty acid desaturase) FAD2 (At)(PubMedID : 27208977)@fatty acid desaturase, putative, expressed K10256: omega-6 fatty acid desaturase / acyl-lipid omega-6 desaturase (Delta-12 desaturase)
2 Sobic.007G171950 - -
3 Sobic.001G266400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G063700 OsFBW2 - F-box domain and WD40 repeat containing protein, expressed -
5 Sobic.010G068400 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
6 Sobic.004G080200 3-oxoacyl-synthase, putative, expressed K09458: fabF, OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase II
7 Sobic.002G000700 expressed protein -
8 Sobic.002G122600 ankyrin repeat domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G445100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13195: cold-inducible RNA-binding protein
10 Sobic.001G058500 expressed protein -
11 Sobic.003G404900 regulatory protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G004700 expressed protein -
13 Sobic.002G395801 - -
14 Sobic.010G067700 expressed protein -
15 Sobic.007G002900 C3-BTB1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with C3 subfamily conserved sequence, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.003G314100 AGAP000951-PA, putative, expressed -
17 Sobic.002G021000 PHLOEM 2-LIKE A10, putative, expressed -
18 Sobic.002G133100 prephenate dehydratase domain containing protein, expressed K05359: ADT, arogenate/prephenate dehydratase
19 Sobic.008G104801 - -
20 Sobic.010G133200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G035501 Sobic008G035501 Sobic004G260800 Sobic004G260800 Sobic008G035501--Sobic004G260800 Sobic007G171950 Sobic007G171950 Sobic008G035501--Sobic007G171950 Sobic001G266400 Sobic001G266400 Sobic008G035501--Sobic001G266400 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic008G035501--Sobic005G063700 Sobic010G068400 Sobic010G068400 Sobic008G035501--Sobic010G068400 Sobic004G080200 Sobic004G080200 Sobic008G035501--Sobic004G080200 Sobic002G000700 Sobic002G000700 Sobic008G035501--Sobic002G000700 Sobic002G122600 Sobic002G122600 Sobic008G035501--Sobic002G122600 Sobic003G445100 Sobic003G445100 Sobic008G035501--Sobic003G445100 Sobic004G260800--Sobic008G035501 Sobic003G404900 Sobic003G404900 Sobic004G260800--Sobic003G404900 Sobic004G026700 Sobic004G026700 Sobic004G260800--Sobic004G026700 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic004G260800--Sobic001G361700 Sobic006G011100 Sobic006G011100 Sobic004G260800--Sobic006G011100 Sobic009G077200 Sobic009G077200 Sobic004G260800--Sobic009G077200 Sobic002G285375 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Octagon: transcription factors


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