Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G054600.1
Synonym Sb08g004630
Functional annotation splicing factor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R4X1
Pfam PF03468
Panther DB PTHR21596 PTHR21596:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G22430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07530.1 : splicing factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025728
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G036740.1 , HORVU5Hr1G036740.3 , HORVU5Hr1G036740.2
Wheat TraesCS5A02G114000 , TraesCS5D02G127800 , TraesCS5B02G119000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G014300 OsFBDUF15 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
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16 Sobic.006G240100 BRCA1-associated protein, putative, expressed K10632: BRCA1-associated protein
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20 Sobic.005G133800 NEF1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G054600 Sobic008G054600 Sobic001G014300 Sobic001G014300 Sobic008G054600--Sobic001G014300 Sobic004G256500 Sobic004G256500 Sobic008G054600--Sobic004G256500 Sobic004G096400 Sobic004G096400 Sobic008G054600--Sobic004G096400 Sobic002G396500 Sobic002G396500 Sobic008G054600--Sobic002G396500 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic008G054600--Sobic003G405500 Sobic006G224800 Sobic006G224800 Sobic008G054600--Sobic006G224800 Sobic009G084900 Sobic009G084900 Sobic008G054600--Sobic009G084900 Sobic006G166200 Sobic006G166200 Sobic008G054600--Sobic006G166200 Sobic004G236800 Sobic004G236800 Sobic008G054600--Sobic004G236800 Sobic001G014300--Sobic008G054600 Sobic003G312700 Sobic003G312700 Sobic001G014300--Sobic003G312700 Sobic002G051750 Sobic002G051750 Sobic001G014300--Sobic002G051750 Sobic001G014300--Sobic004G096400 Sobic004G265500 Sobic004G265500 Sobic001G014300--Sobic004G265500 Sobic006G080400 Sobic006G080400 Sobic001G014300--Sobic006G080400 Sobic003G163200 Sobic003G163200 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Sobic010G187600 Sobic010G187600 Sobic004G236800--Sobic010G187600 Sobic004G236800--Sobic001G145400
Octagon: transcription factors


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