Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G115000.1
Synonym VRN5, VIL1, Sb08g016860
Functional annotation Fibronectin type III domain containing protein, expressed
UniProt C5YPA1
Pfam PF00041 PF07227
Panther DB PTHR21736 PTHR21736:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G24440 : Fibronectin type III domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g34850.1 : Fibronectin type III domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054379 , Zm00025a025564
Brachypodium KQJ86500
Barley -
Wheat TraesCS5D02G109600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G115000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G165800 - -
2 Sobic.007G046200 ELF7, putative, expressed K15174: RNA polymerase II-associated factor 1
3 Sobic.007G018200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.007G026000 ATBET9, putative, expressed -
5 Sobic.005G207500 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G353600 expressed protein -
7 Sobic.003G212900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G180900 PSP domain containing protein, expressed K13128: zinc finger CCHC domain-containing protein 8
9 Sobic.002G067800 - -
10 Sobic.004G311400 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G051700 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G102800 mitochondrial carrier protein, putative, expressed K05863: SLC25A4S, solute carrier family 25 (mitochondrial adenine nucleotide translocator), member 4/5/6/31
13 Sobic.001G517500 Ubiquitin family domain containing protein, expressed K04523: UBQLN, ubiquilin
14 Sobic.005G059100 bromodomain domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G036300 marker Xucw84, putative, expressed -
16 Sobic.003G073000 IWS1 C-terminus family protein, putative, expressed K17498: SPN1, transcription factor SPN1
17 Sobic.001G426900 coronatine-insensitive protein, putative, expressed K13463: coronatine-insensitive protein 1
18 Sobic.010G167900 expressed protein K14376: poly(A) polymerase
19 Sobic.004G088200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G041500 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17506: PPM1L, protein phosphatase 1L


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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