Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G092020.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1R0
Pfam PF04366 PF01363
Panther DB PTHR15629 PTHR15629:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G43230 : RING/FYVE/PHD-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g17130.1 : FYVE zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045563
Brachypodium KQK20177 , KQK20179 , KQK20178 , KQK20180 , KQK20181
Barley HORVU3Hr1G016350.6 , HORVU3Hr1G016350.7 , HORVU3Hr1G016350.4 , HORVU3Hr1G016350.5 , HORVU3Hr1G016350.2 , HORVU3Hr1G016350.3 , HORVU3Hr1G016350.1 , HORVU3Hr1G016350.8
Wheat TraesCS3A02G091400 , TraesCS3B02G106600 , TraesCS3D02G091300
Populus -


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FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G092060 - -
2 Sobic.002G391600 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
3 Sobic.001G094600 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.004G171200 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13124: mitogen-activated protein kinase organizer 1
5 Sobic.001G002000 protein kinase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G168100 BZIP protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G267800 nmrA-like family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G216100 expressed protein -
9 Sobic.001G493200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed K12603: CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6
10 Sobic.010G140400 poor homologous synapsis 1 protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G032700 - -
12 Sobic.008G000400 GHMP kinases ATP-binding protein, putative, expressed K16190: glucuronokinase
13 Sobic.003G312500 transcription factor jumonji, putative, expressed -
14 Sobic.010G273000 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
15 Sobic.010G010700 PHD-finger family protein, expressed -
16 Sobic.004G034800 OsFBX440 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G283600 NTMC2Type1.2 protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G279450 - K11446: KDM5, [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
19 Sobic.001G151100 CCR4-NOT transcription factor, putative, expressed K12580: CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3
20 Sobic.008G016300 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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