Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G141900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8H4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
2 Sobic.004G035000 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase mraW, putative, expressed -
3 Sobic.002G114700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
4 Sobic.001G028100 - -
5 Sobic.007G069400 pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.001G537700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- K13179: DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18/HAS1
7 Sobic.003G416100 flowering promoting factor-like 1, putative, expressed -
8 Sobic.006G219250 - -
9 Sobic.003G358900 transporter, major facilitator family, putative, expressed K08193: MFS transporter, ACS family, solute carrier family 17 (sodium-dependent inorganic phosphate cotransporter), other
10 Sobic.010G076300 - -
11 Sobic.001G054100 spo0B-associated GTP-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G190900 mTERF domain containing protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
13 Sobic.007G002000 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G212700 ras-related protein, putative, expressed K07897: Ras-related protein Rab-7A
15 Sobic.002G229200 zinc knuckle family protein, expressed -
16 Sobic.005G039500 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
17 Sobic.001G016100 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.009G007800 TruB family pseudouridylate synthase, putative, expressed K03177: truB, PUS4, tRNA pseudouridine55 synthase
19 Sobic.005G110475 - -
20 Sobic.002G168300 RGH2B, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G141900 Sobic009G141900 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic009G141900--Sobic009G085400 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic009G141900--Sobic004G035000 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic009G141900--Sobic002G114700 Sobic001G028100 Sobic001G028100 Sobic009G141900--Sobic001G028100 Sobic007G069400 Sobic007G069400 Sobic009G141900--Sobic007G069400 Sobic001G537700 Sobic001G537700 Sobic009G141900--Sobic001G537700 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic009G141900--Sobic003G416100 Sobic006G219250 Sobic006G219250 Sobic009G141900--Sobic006G219250 Sobic003G358900 Sobic003G358900 Sobic009G141900--Sobic003G358900 Sobic009G085400--Sobic003G416100 Sobic010G248600 Sobic010G248600 Sobic009G085400--Sobic010G248600 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic002G114700 Sobic003G106200 Sobic003G106200 Sobic009G085400--Sobic003G106200 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic009G085400--Sobic005G046500 Sobic009G085400--Sobic004G035000 Sobic007G002000 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Octagon: transcription factors


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