Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G074920.1
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UniProt A0A1W0VRX6
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G310500 chalcone synthase, putative, expressed -
2 Sobic.001G478200 - -
3 Sobic.003G176350 - -
4 Sobic.010G006000 expressed protein -
5 Sobic.010G006100 expressed protein -
6 Sobic.010G113600 vignain precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G067450 - -
8 Sobic.004G227800 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G203301 - -
10 Sobic.008G187700 expressed protein -
11 Sobic.007G020900 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
12 Sobic.005G203100 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
13 Sobic.003G255500 expressed protein -
14 Sobic.009G154700 Ferredoxin-6(PubMedID : 26186930)@2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
15 Sobic.009G108300 inhibitor I family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G107700 expressed protein -
17 Sobic.009G016300 ZOS5-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.004G217800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ammonium transporter protein, putative, expressed K03320: amt, AMT, ammonium transporter, Amt family
19 Sobic.004G176600 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G437200 sulfotransferase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G074920 Sobic010G074920 Sobic002G310500 Sobic002G310500 Sobic010G074920--Sobic002G310500 Sobic001G478200 Sobic001G478200 Sobic010G074920--Sobic001G478200 Sobic003G176350 Sobic003G176350 Sobic010G074920--Sobic003G176350 Sobic010G006000 Sobic010G006000 Sobic010G074920--Sobic010G006000 Sobic010G006100 Sobic010G006100 Sobic010G074920--Sobic010G006100 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic010G074920--Sobic010G113600 Sobic009G067450 Sobic009G067450 Sobic010G074920--Sobic009G067450 Sobic004G227800 Sobic004G227800 Sobic010G074920--Sobic004G227800 Sobic004G203301 Sobic004G203301 Sobic010G074920--Sobic004G203301 Sobic007G148000 Sobic007G148000 Sobic002G310500--Sobic007G148000 Sobic009G108300 Sobic009G108300 Sobic002G310500--Sobic009G108300 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic002G310500--Sobic003G426100 Sobic004G180301 Sobic004G180301 Sobic002G310500--Sobic004G180301 Sobic002G310500--Sobic010G113600 Sobic002G310500--Sobic001G478200 Sobic008G082200 Sobic008G082200 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Octagon: transcription factors


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