Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G175350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTK9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g38120.1 : low-affinity cation transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G002200 formin-like protein 1 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.003G290400 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.005G196600 expressed protein -
4 Sobic.002G112000 protein binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G037901 - -
6 Sobic.009G156400 tubulin-specific chaperone E, putative, expressed -
7 Sobic.003G129500 argonaute, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
8 Sobic.005G153000 agenet domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G031800 - -
10 Sobic.008G118100 kelch repeat protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G050800 abhydrolase domain-containing protein FAM108C1, putative, expressed -
12 Sobic.002G187600 expressed protein -
13 Sobic.010G190800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF1680 domain containing protein, putative, expressed K09955: uncharacterized protein
14 Sobic.009G222400 expressed protein -
15 Sobic.004G190500 sucrose transporters("PubMedID : 27986867,PubMedID : 23805151")@Sucrose transporter genes(PubMedID : 24456189)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@sucrose transporter BoSUT1, putative, expressed K15378: solute carrier family 45, member 1/2/4
16 Sobic.004G282601 - -
17 Sobic.004G078500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
18 Sobic.007G050900 - -
19 Sobic.001G081800 GASR3 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G335500 OsFBX255 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G175350 Sobic010G175350 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic010G175350--Sobic009G002200 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic010G175350--Sobic003G290400 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic010G175350--Sobic005G196600 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic010G175350--Sobic002G112000 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic010G175350--Sobic010G037901 Sobic009G156400 Sobic009G156400 Sobic010G175350--Sobic009G156400 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic010G175350--Sobic003G129500 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic010G175350--Sobic005G153000 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic010G175350--Sobic009G031800 Sobic007G050800 Sobic007G050800 Sobic009G002200--Sobic007G050800 Sobic009G002200--Sobic003G290400 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic009G002200--Sobic004G282601 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic009G002200--Sobic006G135800 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic009G002200--Sobic005G036200 Sobic009G002200--Sobic005G153000 Sobic001G375800 Sobic001G375800 Sobic009G002200--Sobic001G375800 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic009G002200--Sobic004G078500 Sobic009G002200--Sobic010G037901 Sobic003G290400--Sobic005G153000 Sobic003G290400--Sobic009G002200 Sobic003G290400--Sobic004G282601 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic003G290400--Sobic009G077300 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic003G290400--Sobic006G221300 Sobic002G027600 Sobic002G027600 Sobic003G290400--Sobic002G027600 Sobic003G290400--Sobic006G135800 Sobic007G162400 Sobic007G162400 Sobic003G290400--Sobic007G162400 Sobic003G259300 Sobic003G259300 Sobic003G290400--Sobic003G259300 Sobic005G196600--Sobic010G037901 Sobic005G196600--Sobic005G153000 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic006G226000 Sobic005G196600--Sobic004G282601 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic003G086800 Sobic005G196600--Sobic009G031800 Sobic001G136400 Sobic001G136400 Sobic005G196600--Sobic001G136400 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic002G055800 Sobic005G196600--Sobic006G135800 Sobic009G057800 Sobic009G057800 Sobic002G112000--Sobic009G057800 Sobic007G201900 Sobic007G201900 Sobic002G112000--Sobic007G201900 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic002G112000--Sobic002G317700 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic002G112000--Sobic008G070700 Sobic010G222800 Sobic010G222800 Sobic002G112000--Sobic010G222800 Sobic002G112000--Sobic003G129500 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic002G112000--Sobic006G272800 Sobic004G190500 Sobic004G190500 Sobic002G112000--Sobic004G190500 Sobic002G112000--Sobic009G002200 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic009G156400--Sobic002G317700 Sobic006G211900 Sobic006G211900 Sobic009G156400--Sobic006G211900 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic009G156400--Sobic008G118100 Sobic009G156400--Sobic002G112000 Sobic003G198016 Sobic003G198016 Sobic009G156400--Sobic003G198016 Sobic001G033300 Sobic001G033300 Sobic009G156400--Sobic001G033300 Sobic009G156400--Sobic010G175350 Sobic003G198048 Sobic003G198048 Sobic009G156400--Sobic003G198048 Sobic009G156400--Sobic004G078500 Sobic003G129500--Sobic005G153000 Sobic003G129500--Sobic002G112000 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic003G129500--Sobic002G168000 Sobic009G012400 Sobic009G012400 Sobic003G129500--Sobic009G012400 Sobic010G250400 Sobic010G250400 Sobic003G129500--Sobic010G250400 Sobic003G423800 Sobic003G423800 Sobic003G129500--Sobic003G423800 Sobic003G370300 Sobic003G370300 Sobic003G129500--Sobic003G370300 Sobic003G129500--Sobic010G222800 Sobic003G183466 Sobic003G183466 Sobic003G129500--Sobic003G183466 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic009G031800--Sobic006G226000 Sobic009G031800--Sobic007G160400 Sobic009G031800--Sobic010G037901 Sobic009G012500 Sobic009G012500 Sobic009G031800--Sobic009G012500 Sobic005G126701 Sobic005G126701 Sobic009G031800--Sobic005G126701 Sobic001G254700 Sobic001G254700 Sobic009G031800--Sobic001G254700 Sobic006G083900 Sobic006G083900 Sobic009G031800--Sobic006G083900 Sobic007G025600 Sobic007G025600 Sobic009G031800--Sobic007G025600 Sobic001G534200 Sobic001G534200 Sobic009G031800--Sobic001G534200
Octagon: transcription factors


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