Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K044404.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VQS8
Pfam PF11891
Panther DB PTHR31038 PTHR31038:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37860 : Protein of unknown function (DUF3411)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44290.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010622
Brachypodium KQJ83666 , KQJ83665
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G302000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
2 Sobic.006G129900 ribosome recycling factor, putative, expressed K02838: frr, MRRF, ribosome recycling factor
3 Sobic.007G040301 - -
4 Sobic.009G151700 protein of unknown function DUF502 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G050500 methylisocitrate lyase 2, putative, expressed -
6 Sobic.003G099166 - -
7 Sobic.001G542100 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.004G152300 X8 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G386200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G055800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
11 Sobic.009G102100 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G164300 - -
13 Sobic.004G104700 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14455: aspartate aminotransferase, mitochondrial
14 Sobic.004G021400 endoglucanase, putative, expressed -
15 Sobic.004G010000 OsSCP6 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09645: vitellogenic carboxypeptidase-like protein
16 Sobic.010G156200 - -
17 Sobic.008G174966 - -
18 Sobic.001G026100 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
19 Sobic.001G168600 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
20 Sobic.002G063400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07943: ADP-ribosylation factor-like protein 2


Gene co-expression network
sample SobicK044404 SobicK044404 Sobic002G302000 Sobic002G302000 SobicK044404--Sobic002G302000 Sobic006G129900 Sobic006G129900 SobicK044404--Sobic006G129900 Sobic007G040301 Sobic007G040301 SobicK044404--Sobic007G040301 Sobic009G151700 Sobic009G151700 SobicK044404--Sobic009G151700 Sobic006G050500 Sobic006G050500 SobicK044404--Sobic006G050500 Sobic003G099166 Sobic003G099166 SobicK044404--Sobic003G099166 Sobic001G542100 Sobic001G542100 SobicK044404--Sobic001G542100 Sobic004G152300 Sobic004G152300 SobicK044404--Sobic004G152300 Sobic003G386200 Sobic003G386200 SobicK044404--Sobic003G386200 Sobic006G144700 Sobic006G144700 Sobic002G302000--Sobic006G144700 Sobic002G302000--Sobic009G151700 Sobic007G139500 Sobic007G139500 Sobic002G302000--Sobic007G139500 Sobic001G196000 Sobic001G196000 Sobic002G302000--Sobic001G196000 Sobic002G302000--Sobic007G040301 Sobic008G174966 Sobic008G174966 Sobic002G302000--Sobic008G174966 Sobic004G010000 Sobic004G010000 Sobic002G302000--Sobic004G010000 Sobic010G090500 Sobic010G090500 Sobic002G302000--Sobic010G090500 Sobic001G437500 Sobic001G437500 Sobic002G302000--Sobic001G437500 Sobic005G047000 Sobic005G047000 Sobic006G129900--Sobic005G047000 Sobic004G010700 Sobic004G010700 Sobic006G129900--Sobic004G010700 Sobic005G178300 Sobic005G178300 Sobic006G129900--Sobic005G178300 Sobic010G258000 Sobic010G258000 Sobic006G129900--Sobic010G258000 Sobic007G165300 Sobic007G165300 Sobic006G129900--Sobic007G165300 Sobic004G015300 Sobic004G015300 Sobic006G129900--Sobic004G015300 Sobic003G248300 Sobic003G248300 Sobic006G129900--Sobic003G248300 Sobic001G176900 Sobic001G176900 Sobic006G129900--Sobic001G176900 Sobic005G110526 Sobic005G110526 Sobic006G129900--Sobic005G110526 Sobic009G206500 Sobic009G206500 Sobic007G040301--Sobic009G206500 Sobic007G040301--Sobic001G437500 Sobic009G026101 Sobic009G026101 Sobic007G040301--Sobic009G026101 Sobic001G144200 Sobic001G144200 Sobic007G040301--Sobic001G144200 Sobic001G406700 Sobic001G406700 Sobic007G040301--Sobic001G406700 Sobic008G141200 Sobic008G141200 Sobic007G040301--Sobic008G141200 Sobic004G274800 Sobic004G274800 Sobic007G040301--Sobic004G274800 Sobic007G040301--Sobic009G151700 Sobic006G267500 Sobic006G267500 Sobic007G040301--Sobic006G267500 Sobic009G151700--Sobic006G267500 Sobic009G151700--Sobic009G206500 Sobic003G345200 Sobic003G345200 Sobic009G151700--Sobic003G345200 Sobic009G151700--Sobic007G139500 Sobic009G246700 Sobic009G246700 Sobic009G151700--Sobic009G246700 Sobic009G151700--Sobic007G040301 Sobic009G061000 Sobic009G061000 Sobic009G151700--Sobic009G061000 Sobic002G161700 Sobic002G161700 Sobic009G151700--Sobic002G161700 Sobic009G119700 Sobic009G119700 Sobic009G151700--Sobic009G119700 Sobic006G050500--Sobic005G178300 Sobic002G272500 Sobic002G272500 Sobic006G050500--Sobic002G272500 Sobic006G050500--Sobic007G165300 Sobic006G050500--Sobic006G129900 Sobic010G073500 Sobic010G073500 Sobic006G050500--Sobic010G073500 Sobic003G170300 Sobic003G170300 Sobic006G050500--Sobic003G170300 Sobic003G085500 Sobic003G085500 Sobic006G050500--Sobic003G085500 Sobic001G506000 Sobic001G506000 Sobic006G050500--Sobic001G506000 Sobic003G113900 Sobic003G113900 Sobic006G050500--Sobic003G113900 Sobic001G208600 Sobic001G208600 Sobic003G099166--Sobic001G208600 Sobic001G484000 Sobic001G484000 Sobic003G099166--Sobic001G484000 Sobic001G263900 Sobic001G263900 Sobic003G099166--Sobic001G263900 Sobic006G075000 Sobic006G075000 Sobic003G099166--Sobic006G075000 Sobic005G052500 Sobic005G052500 Sobic003G099166--Sobic005G052500 Sobic003G082700 Sobic003G082700 Sobic003G099166--Sobic003G082700 Sobic003G352700 Sobic003G352700 Sobic003G099166--Sobic003G352700 Sobic002G347300 Sobic002G347300 Sobic003G099166--Sobic002G347300 Sobic009G221900 Sobic009G221900 Sobic003G099166--Sobic009G221900 Sobic004G021400 Sobic004G021400 Sobic001G542100--Sobic004G021400 Sobic007G120200 Sobic007G120200 Sobic001G542100--Sobic007G120200 Sobic002G109100 Sobic002G109100 Sobic001G542100--Sobic002G109100 Sobic007G083000 Sobic007G083000 Sobic001G542100--Sobic007G083000 Sobic001G458400 Sobic001G458400 Sobic001G542100--Sobic001G458400 Sobic001G542100--Sobic004G010000 Sobic006G172200 Sobic006G172200 Sobic001G542100--Sobic006G172200 Sobic001G542100--Sobic006G144700 Sobic009G153500 Sobic009G153500 Sobic001G542100--Sobic009G153500 Sobic010G261000 Sobic010G261000 Sobic004G152300--Sobic010G261000 Sobic001G501600 Sobic001G501600 Sobic004G152300--Sobic001G501600 Sobic010G224400 Sobic010G224400 Sobic004G152300--Sobic010G224400 Sobic004G036800 Sobic004G036800 Sobic004G152300--Sobic004G036800 Sobic010G005000 Sobic010G005000 Sobic004G152300--Sobic010G005000 Sobic002G222200 Sobic002G222200 Sobic004G152300--Sobic002G222200 Sobic005G120500 Sobic005G120500 Sobic004G152300--Sobic005G120500 Sobic010G265900 Sobic010G265900 Sobic004G152300--Sobic010G265900 Sobic006G095200 Sobic006G095200 Sobic004G152300--Sobic006G095200 Sobic006G036400 Sobic006G036400 Sobic003G386200--Sobic006G036400 Sobic009G226900 Sobic009G226900 Sobic003G386200--Sobic009G226900 Sobic003G296400 Sobic003G296400 Sobic003G386200--Sobic003G296400 Sobic003G062000 Sobic003G062000 Sobic003G386200--Sobic003G062000 Sobic003G427900 Sobic003G427900 Sobic003G386200--Sobic003G427900 Sobic009G162500 Sobic009G162500 Sobic003G386200--Sobic009G162500 Sobic002G205500 Sobic002G205500 Sobic003G386200--Sobic002G205500 Sobic001G224300 Sobic001G224300 Sobic003G386200--Sobic001G224300 Sobic001G534532 Sobic001G534532 Sobic003G386200--Sobic001G534532
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.