Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G430400.1,Sobic.001G430400.3,Sobic.001G430400.2
Synonym
Functional annotation Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QP91 , A0A1Z5SAE3
Pfam PF00149
Panther DB PTHR14795 PTHR14795:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G03305 : Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g15430.1 : Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052827
Brachypodium PNT77707 , KQK22481 , KQK22483 , KQK22482
Barley HORVU4Hr1G061810.1 , HORVU4Hr1G061810.2
Wheat TraesCS4A02G086800 , TraesCS4D02G218000 , TraesCS4B02G217600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G256700 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
2 Sobic.008G144900 DUF221 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.008G087866 - -
4 Sobic.001G191700 expressed protein -
5 Sobic.001G117200 AGC_AGC_other_GWLd.2 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
6 Sobic.006G032300 HECT-domain domain containing protein, expressed K10590: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12
7 Sobic.007G000200 expressed protein -
8 Sobic.001G277900 expressed protein -
9 Sobic.002G371300 peroxisome assembly protein, putative, expressed K13346: peroxin-10
10 Sobic.006G088200 nonsense-mediated decay UPF3, putative, expressed K14328: UPF3, regulator of nonsense transcripts 3
11 Sobic.006G250300 pelota, putative, expressed K06965: PELO, DOM34, protein pelota
12 Sobic.002G311100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G400500 calpain, putative, expressed -
14 Sobic.001G178300 DNA-binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G163100 expressed protein K14972: PAXIP1, PAX-interacting protein 1
16 Sobic.002G346400 transmembrane protein 49, putative, expressed -
17 Sobic.008G002300 ATSIZ1/SIZ1, putative, expressed -
18 Sobic.002G335600 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
19 Sobic.003G089000 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed K10581: ubiquitin-conjugating enzyme E2 O
20 Sobic.002G146300 cig3, putative, expressed K14409: SMG7, protein SMG7


Gene co-expression network
sample Sobic001G430400 Sobic001G430400 Sobic002G256700 Sobic002G256700 Sobic001G430400--Sobic002G256700 Sobic008G144900 Sobic008G144900 Sobic001G430400--Sobic008G144900 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic001G430400--Sobic008G087866 Sobic001G191700 Sobic001G191700 Sobic001G430400--Sobic001G191700 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic001G430400--Sobic001G117200 Sobic006G032300 Sobic006G032300 Sobic001G430400--Sobic006G032300 Sobic007G000200 Sobic007G000200 Sobic001G430400--Sobic007G000200 Sobic001G277900 Sobic001G277900 Sobic001G430400--Sobic001G277900 Sobic002G371300 Sobic002G371300 Sobic001G430400--Sobic002G371300 Sobic003G104000 Sobic003G104000 Sobic002G256700--Sobic003G104000 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic002G256700--Sobic001G493700 Sobic007G054800 Sobic007G054800 Sobic002G256700--Sobic007G054800 Sobic001G251100 Sobic001G251100 Sobic002G256700--Sobic001G251100 Sobic002G142900 Sobic002G142900 Sobic002G256700--Sobic002G142900 Sobic004G131300 Sobic004G131300 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Octagon: transcription factors


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