Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G144900.1,Sobic.008G144900.2
Synonym HYP1, ATHYP1, Sb08g019525
Functional annotation DUF221 domain containing protein, expressed
UniProt C5YQS7 , A0A1Z5R7M7
Pfam PF02714 PF13967 PF02714
Panther DB PTHR13018 PTHR13018:SF32
NCBI CDD KOG1134; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01100 : hypothetical protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39320.1 : DUF221 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004414
Brachypodium KQJ86111
Barley HORVU5Hr1G018700.3 , HORVU5Hr1G018700.2
Wheat TraesCS5B02G077400 , TraesCS5D02G083600 , TraesCS5D02G083600 , TraesCS5D02G083600 , TraesCS5A02G071400
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cDNA sequences
Sobic.008G144900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G001500 HECT-domain domain containing protein, expressed K10590: E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12


Gene co-expression network
sample Sobic008G144900 Sobic008G144900 Sobic001G430400 Sobic001G430400 Sobic008G144900--Sobic001G430400 Sobic002G346400 Sobic002G346400 Sobic008G144900--Sobic002G346400 Sobic006G032300 Sobic006G032300 Sobic008G144900--Sobic006G032300 Sobic001G446850 Sobic001G446850 Sobic008G144900--Sobic001G446850 Sobic010G089400 Sobic010G089400 Sobic008G144900--Sobic010G089400 Sobic008G060000 Sobic008G060000 Sobic008G144900--Sobic008G060000 Sobic009G074400 Sobic009G074400 Sobic008G144900--Sobic009G074400 Sobic003G388100 Sobic003G388100 Sobic008G144900--Sobic003G388100 Sobic008G039100 Sobic008G039100 Sobic008G144900--Sobic008G039100 Sobic002G256700 Sobic002G256700 Sobic001G430400--Sobic002G256700 Sobic001G430400--Sobic008G144900 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic001G430400--Sobic008G087866 Sobic001G191700 Sobic001G191700 Sobic001G430400--Sobic001G191700 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic001G430400--Sobic001G117200 Sobic001G430400--Sobic006G032300 Sobic007G000200 Sobic007G000200 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Octagon: transcription factors


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