Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G223000.1
Synonym Sb07g028820
Functional annotation hypothetical protein
UniProt C5YJM7
Pfam -
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g27200.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004968
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G257750 - -
2 Sobic.003G398700 expressed protein K15210: snRNA-activating protein complex subunit 3
3 Sobic.005G100700 mRNA-capping enzyme, putative, expressed -
4 Sobic.003G221900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G054000 tRNA nucleotidyltransferase/polyA polymerase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G132600 selenoprotein O, putative, expressed -
7 Sobic.002G344000 expressed protein -
8 Sobic.002G211800 AT-rich interaction region, putative, expressed -
9 Sobic.010G021500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G169800 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K09503: DnaJ homolog subfamily A member 2
11 Sobic.003G316500 expressed protein -
12 Sobic.003G388100 expressed protein -
13 Sobic.007G159900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
14 Sobic.005G126600 OsFBL55 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.003G340600 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G089400 TLD family protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G131800 sirohydrochlorin ferrochelatase, putative, expressed -
18 Sobic.003G150100 expressed protein -
19 Sobic.003G294300 S4 domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G332500 WRKY81, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G223000 Sobic007G223000 Sobic002G257750 Sobic002G257750 Sobic007G223000--Sobic002G257750 Sobic003G398700 Sobic003G398700 Sobic007G223000--Sobic003G398700 Sobic005G100700 Sobic005G100700 Sobic007G223000--Sobic005G100700 Sobic003G221900 Sobic003G221900 Sobic007G223000--Sobic003G221900 Sobic008G054000 Sobic008G054000 Sobic007G223000--Sobic008G054000 Sobic010G132600 Sobic010G132600 Sobic007G223000--Sobic010G132600 Sobic002G344000 Sobic002G344000 Sobic007G223000--Sobic002G344000 Sobic002G211800 Sobic002G211800 Sobic007G223000--Sobic002G211800 Sobic010G021500 Sobic010G021500 Sobic007G223000--Sobic010G021500 Sobic002G257750--Sobic003G398700 Sobic005G106600 Sobic005G106600 Sobic002G257750--Sobic005G106600 Sobic003G119600 Sobic003G119600 Sobic002G257750--Sobic003G119600 Sobic003G253600 Sobic003G253600 Sobic002G257750--Sobic003G253600 Sobic006G185100 Sobic006G185100 Sobic002G257750--Sobic006G185100 Sobic003G388100 Sobic003G388100 Sobic002G257750--Sobic003G388100 Sobic006G050700 Sobic006G050700 Sobic002G257750--Sobic006G050700 Sobic004G244900 Sobic004G244900 Sobic002G257750--Sobic004G244900 Sobic002G257750--Sobic010G132600 Sobic003G398700--Sobic002G257750 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic003G398700--Sobic001G456900 Sobic008G044100 Sobic008G044100 Sobic003G398700--Sobic008G044100 Sobic003G398700--Sobic010G021500 Sobic007G136800 Sobic007G136800 Sobic003G398700--Sobic007G136800 Sobic004G185800 Sobic004G185800 Sobic003G398700--Sobic004G185800 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic003G398700--Sobic003G168100 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic003G398700--Sobic008G113100 Sobic010G126000 Sobic010G126000 Sobic003G398700--Sobic010G126000 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic005G100700--Sobic003G360400 Sobic005G100700--Sobic002G344000 Sobic007G159900 Sobic007G159900 Sobic005G100700--Sobic007G159900 Sobic003G389200 Sobic003G389200 Sobic005G100700--Sobic003G389200 Sobic005G100700--Sobic008G113100 Sobic007G146100 Sobic007G146100 Sobic005G100700--Sobic007G146100 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic005G100700--Sobic006G096900 Sobic001G456300 Sobic001G456300 Sobic005G100700--Sobic001G456300 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic005G100700--Sobic010G112100 Sobic001G122832 Sobic001G122832 Sobic003G221900--Sobic001G122832 Sobic003G316500 Sobic003G316500 Sobic003G221900--Sobic003G316500 Sobic003G340600 Sobic003G340600 Sobic003G221900--Sobic003G340600 Sobic001G389100 Sobic001G389100 Sobic003G221900--Sobic001G389100 Sobic003G221900--Sobic010G021500 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic003G221900--Sobic006G133900 Sobic010G147100 Sobic010G147100 Sobic003G221900--Sobic010G147100 Sobic001G332500 Sobic001G332500 Sobic003G221900--Sobic001G332500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic003G221900--Sobic003G029700 Sobic008G054000--Sobic004G244900 Sobic004G356700 Sobic004G356700 Sobic008G054000--Sobic004G356700 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic008G054000--Sobic004G334300 Sobic008G054000--Sobic002G257750 Sobic008G054000--Sobic008G044100 Sobic008G054000--Sobic003G398700 Sobic003G101700 Sobic003G101700 Sobic008G054000--Sobic003G101700 Sobic002G316600 Sobic002G316600 Sobic008G054000--Sobic002G316600 Sobic008G054000--Sobic002G344000 Sobic010G132600--Sobic002G257750 Sobic004G146600 Sobic004G146600 Sobic010G132600--Sobic004G146600 Sobic010G132600--Sobic005G106600 Sobic005G132000 Sobic005G132000 Sobic010G132600--Sobic005G132000 Sobic010G132600--Sobic004G356700 Sobic003G057233 Sobic003G057233 Sobic010G132600--Sobic003G057233 Sobic010G132600--Sobic003G398700 Sobic003G029500 Sobic003G029500 Sobic010G132600--Sobic003G029500 Sobic004G231900 Sobic004G231900 Sobic010G132600--Sobic004G231900 Sobic002G344000--Sobic005G100700 Sobic002G344000--Sobic008G044100 Sobic002G344000--Sobic003G360400 Sobic002G344000--Sobic002G211800 Sobic001G230000 Sobic001G230000 Sobic002G344000--Sobic001G230000 Sobic002G344000--Sobic008G113100 Sobic002G344000--Sobic003G398700 Sobic001G354600 Sobic001G354600 Sobic002G344000--Sobic001G354600 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic002G344000--Sobic010G206900 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic002G211800--Sobic009G165700 Sobic007G031900 Sobic007G031900 Sobic002G211800--Sobic007G031900 Sobic002G211800--Sobic002G344000 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic002G211800--Sobic003G166750 Sobic004G023000 Sobic004G023000 Sobic002G211800--Sobic004G023000 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic002G211800--Sobic009G132700 Sobic003G170900 Sobic003G170900 Sobic002G211800--Sobic003G170900 Sobic002G294800 Sobic002G294800 Sobic002G211800--Sobic002G294800 Sobic003G362600 Sobic003G362600 Sobic002G211800--Sobic003G362600 Sobic010G021500--Sobic003G398700 Sobic010G167900 Sobic010G167900 Sobic010G021500--Sobic010G167900 Sobic010G021500--Sobic008G113100 Sobic010G021500--Sobic006G096900 Sobic010G021500--Sobic001G456900 Sobic010G149200 Sobic010G149200 Sobic010G021500--Sobic010G149200 Sobic005G027400 Sobic005G027400 Sobic010G021500--Sobic005G027400 Sobic010G021500--Sobic005G100700 Sobic010G021500--Sobic003G221900
Octagon: transcription factors


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