Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G469400.3,Sobic.001G469400.2
Synonym Sb01g043990
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WUN7
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ83130
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
2 Sobic.008G153600 WRKY94, expressed -
3 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
4 Sobic.007G191100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
5 Sobic.007G094801 - -
6 Sobic.008G136200 spotted leaf 11, putative, expressed -
7 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
9 Sobic.003G144400 homeobox protein knotted-1-like 6, putative, expressed -
10 Sobic.002G076400 structural constituent of ribosome, putative, expressed -
11 Sobic.007G011400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G077600 gb protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G142050 - -
15 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.001G285400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed -
17 Sobic.004G271900 RMD5 homolog A, putative, expressed -
18 Sobic.010G074500 -(PubMedID : 26320239)@phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
19 Sobic.001G428000 uncharacterized TPR repeat-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G041700 TLD family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G469400 Sobic001G469400 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic001G469400--Sobic009G045700 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic001G469400--Sobic008G153600 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic001G469400--Sobic008G034600 Sobic007G191100 Sobic007G191100 Sobic001G469400--Sobic007G191100 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic001G469400--Sobic007G094801 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic001G469400--Sobic008G136200 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic001G469400--Sobic008G068800 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic001G469400--Sobic008G117200 Sobic003G144400 Sobic003G144400 Sobic001G469400--Sobic003G144400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic008G153600--Sobic009G045700 Sobic008G153600--Sobic007G094801 Sobic008G153600--Sobic008G136200 Sobic008G153600--Sobic008G034600 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G153600--Sobic009G197200 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic008G153600--Sobic009G087800 Sobic004G211400 Sobic004G211400 Sobic008G153600--Sobic004G211400 Sobic008G153600--Sobic003G144400 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic008G153600--Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G205800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic010G263800 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic004G271900 Sobic008G034600--Sobic008G117200 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic008G034600--Sobic002G421700 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic008G034600--Sobic009G022200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic007G224900 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic008G034600--Sobic003G346000 Sobic004G061900 Sobic004G061900 Sobic007G191100--Sobic004G061900 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic007G191100--Sobic002G076400 Sobic007G191100--Sobic008G034600 Sobic010G077600 Sobic010G077600 Sobic007G191100--Sobic010G077600 Sobic007G191100--Sobic010G263800 Sobic007G191100--Sobic007G011400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic007G191100--Sobic010G074500 Sobic003G093600 Sobic003G093600 Sobic007G191100--Sobic003G093600 Sobic007G191100--Sobic008G117200 Sobic007G094801--Sobic010G074500 Sobic007G094801--Sobic010G263800 Sobic007G094801--Sobic007G011400 Sobic007G094801--Sobic008G034600 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic007G094801--Sobic006G129700 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic007G094801--Sobic003G315332 Sobic007G094801--Sobic007G205800 Sobic007G094801--Sobic007G191100 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G094801--Sobic004G143700 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic008G136200--Sobic002G144933 Sobic008G136200--Sobic007G205800 Sobic008G136200--Sobic007G011400 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic008G136200--Sobic009G215800 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic008G136200--Sobic009G065100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic008G136200--Sobic001G094000 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic008G136200--Sobic002G157000 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic008G136200--Sobic003G197800 Sobic008G136200--Sobic009G087800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic008G117200--Sobic010G263800 Sobic008G117200--Sobic008G034600 Sobic008G117200--Sobic001G094000 Sobic004G088400 Sobic004G088400 Sobic008G117200--Sobic004G088400 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G177400 Sobic008G117200--Sobic002G421700 Sobic008G117200--Sobic007G116400 Sobic008G117200--Sobic007G011400 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic008G117200--Sobic001G477800 Sobic003G144400--Sobic008G153600 Sobic003G144400--Sobic009G045700 Sobic003G144400--Sobic001G469400 Sobic001G274700 Sobic001G274700 Sobic003G144400--Sobic001G274700 Sobic009G214600 Sobic009G214600 Sobic003G144400--Sobic009G214600 Sobic006G038400 Sobic006G038400 Sobic003G144400--Sobic006G038400 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic003G144400--Sobic006G204200 Sobic003G144400--Sobic007G094801 Sobic009G114600 Sobic009G114600 Sobic003G144400--Sobic009G114600
Octagon: transcription factors


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