Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G015266.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1U2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02600.1 : DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G127000 - -
2 Sobic.001G305000 stress responsive protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G183600 - -
4 Sobic.008G006700 expressed protein -
5 Sobic.002G186500 UPF0041 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G113200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
7 Sobic.001G020700 expressed protein -
8 Sobic.001G265100 - -
9 Sobic.003G284100 expressed protein -
10 Sobic.009G021500 expressed protein -
11 Sobic.003G139200 - -
12 Sobic.002G377900 mitosis protein dim1, putative, expressed -
13 Sobic.002G424200 SNF1-related protein kinase regulatory subunit beta-1, putative, expressed K07199: 5'-AMP-activated protein kinase, regulatory beta subunit
14 Sobic.001G485000 expressed protein -
15 Sobic.002G361500 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@Indole-acetic acid (IAA)-amido synthetase(PubMedID : 30367619)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
16 Sobic.001G505700 expressed protein -
17 Sobic.005G018600 - -
18 Sobic.001G365700 OsRhmbd13 - Putative Rhomboid homologue, expressed -
19 Sobic.004G328100 expressed protein -
20 Sobic.010G198400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G015266 Sobic002G015266 Sobic004G127000 Sobic004G127000 Sobic002G015266--Sobic004G127000 Sobic001G305000 Sobic001G305000 Sobic002G015266--Sobic001G305000 Sobic008G183600 Sobic008G183600 Sobic002G015266--Sobic008G183600 Sobic008G006700 Sobic008G006700 Sobic002G015266--Sobic008G006700 Sobic002G186500 Sobic002G186500 Sobic002G015266--Sobic002G186500 Sobic002G113200 Sobic002G113200 Sobic002G015266--Sobic002G113200 Sobic001G020700 Sobic001G020700 Sobic002G015266--Sobic001G020700 Sobic001G265100 Sobic001G265100 Sobic002G015266--Sobic001G265100 Sobic003G284100 Sobic003G284100 Sobic002G015266--Sobic003G284100 Sobic001G365700 Sobic001G365700 Sobic004G127000--Sobic001G365700 Sobic004G127000--Sobic002G113200 Sobic010G043250 Sobic010G043250 Sobic004G127000--Sobic010G043250 Sobic003G137600 Sobic003G137600 Sobic004G127000--Sobic003G137600 Sobic004G173700 Sobic004G173700 Sobic004G127000--Sobic004G173700 Sobic004G127000--Sobic003G284100 Sobic003G212000 Sobic003G212000 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Octagon: transcription factors


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