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Transcriptome id Sobic.002G155301.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1W0W438
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G430000 expressed protein K08518: STXBP5, syntaxin-binding protein 5
2 Sobic.001G117200 AGC_AGC_other_GWLd.2 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
3 Sobic.007G133700 expressed protein -
4 Sobic.003G422500 expressed protein -
5 Sobic.001G281100 START domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G004200 expressed protein -
7 Sobic.008G098900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative, expressed K11838: USP7, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
8 Sobic.008G087866 - -
9 Sobic.004G113400 cyclic nucleotide-gated ion channel 1, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
10 Sobic.004G347400 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
11 Sobic.005G157000 expressed protein -
12 Sobic.004G355000 SAC9, putative, expressed -
13 Sobic.004G329400 formin, putative, expressed -
14 Sobic.001G085300 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
15 Sobic.009G165700 SAC3/GANP family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G004300 expressed protein -
17 Sobic.003G101400 transcriptional repressor, putative, expressed K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
18 Sobic.004G065000 expressed protein -
19 Sobic.004G269200 protein kinase, putative, expressed K18670: dual specificity protein kinase YAK1
20 Sobic.001G273700 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin


Gene co-expression network
sample Sobic002G155301 Sobic002G155301 Sobic002G430000 Sobic002G430000 Sobic002G155301--Sobic002G430000 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic002G155301--Sobic001G117200 Sobic007G133700 Sobic007G133700 Sobic002G155301--Sobic007G133700 Sobic003G422500 Sobic003G422500 Sobic002G155301--Sobic003G422500 Sobic001G281100 Sobic001G281100 Sobic002G155301--Sobic001G281100 Sobic004G004200 Sobic004G004200 Sobic002G155301--Sobic004G004200 Sobic008G098900 Sobic008G098900 Sobic002G155301--Sobic008G098900 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic002G155301--Sobic008G087866 Sobic004G113400 Sobic004G113400 Sobic002G155301--Sobic004G113400 Sobic001G207400 Sobic001G207400 Sobic002G430000--Sobic001G207400 Sobic002G430000--Sobic001G117200 Sobic004G355000 Sobic004G355000 Sobic002G430000--Sobic004G355000 Sobic002G430000--Sobic008G098900 Sobic001G016700 Sobic001G016700 Sobic002G430000--Sobic001G016700 Sobic002G430000--Sobic004G113400 Sobic010G139600 Sobic010G139600 Sobic002G430000--Sobic010G139600 Sobic008G092600 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Octagon: transcription factors


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