Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G325100.1
Synonym Sb02g035240
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XA65
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g34690.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G082200 osFTL7 FT-Like7 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
2 Sobic.002G290500 armadillo/beta-catenin repeat protein-related, putative, expressed -
3 Sobic.002G419500 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
4 Sobic.002G338250 - -
5 Sobic.005G203100 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
6 Sobic.002G401566 - -
7 Sobic.009G139700 - -
8 Sobic.008G034000 avr9/Cf-9 rapidly elicited protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G426700 expressed protein -
10 Sobic.007G005700 expressed protein -
11 Sobic.007G065900 Cupin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G112300 expressed protein -
13 Sobic.004G117600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY39, expressed -
14 Sobic.010G023000 expressed protein -
15 Sobic.005G062800 expressed protein -
16 Sobic.001G191800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G348500 expressed protein -
18 Sobic.001G508600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@-(PubMedID : 29751546)@zinc finger family protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G333150 - -
20 Sobic.004G056201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G325100 Sobic002G325100 Sobic008G082200 Sobic008G082200 Sobic002G325100--Sobic008G082200 Sobic002G290500 Sobic002G290500 Sobic002G325100--Sobic002G290500 Sobic002G419500 Sobic002G419500 Sobic002G325100--Sobic002G419500 Sobic002G338250 Sobic002G338250 Sobic002G325100--Sobic002G338250 Sobic005G203100 Sobic005G203100 Sobic002G325100--Sobic005G203100 Sobic002G401566 Sobic002G401566 Sobic002G325100--Sobic002G401566 Sobic009G139700 Sobic009G139700 Sobic002G325100--Sobic009G139700 Sobic008G034000 Sobic008G034000 Sobic002G325100--Sobic008G034000 Sobic002G426700 Sobic002G426700 Sobic002G325100--Sobic002G426700 Sobic007G148000 Sobic007G148000 Sobic008G082200--Sobic007G148000 Sobic010G023000 Sobic010G023000 Sobic008G082200--Sobic010G023000 Sobic008G082200--Sobic005G203100 Sobic002G368500 Sobic002G368500 Sobic008G082200--Sobic002G368500 Sobic003G240600 Sobic003G240600 Sobic008G082200--Sobic003G240600 Sobic008G082200--Sobic002G325100 Sobic008G060050 Sobic008G060050 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Octagon: transcription factors


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