Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G375800.1
Synonym Sb02g039340, ALAAT2
Functional annotation - (PubMedID : 26976818)
aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed
UniProt C5X2E3
Pfam PF00155
Panther DB PTHR11751 PTHR11751:SF369
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00814; GPT, alanine transaminase
Gene Ontology GO:0009058; biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G72330 : alanine aminotransferase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g42600.1 : aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015221 , Zm00025a042656 , Zm00025a048765
Brachypodium KQJ96451 , KQK15146
Barley HORVU2Hr1G030820.4 , HORVU2Hr1G030820.1 , HORVU2Hr1G030820.3 , HORVU2Hr1G030820.2
Wheat TraesCS2B02G193600 , TraesCS2D02G175200 , TraesCS2A02G167500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G375800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G231500 phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01923: phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase


Gene co-expression network
sample Sobic002G375800 Sobic002G375800 Sobic008G113600 Sobic008G113600 Sobic002G375800--Sobic008G113600 Sobic009G117500 Sobic009G117500 Sobic002G375800--Sobic009G117500 Sobic004G060100 Sobic004G060100 Sobic002G375800--Sobic004G060100 Sobic008G150300 Sobic008G150300 Sobic002G375800--Sobic008G150300 Sobic008G190100 Sobic008G190100 Sobic002G375800--Sobic008G190100 Sobic008G186200 Sobic008G186200 Sobic002G375800--Sobic008G186200 Sobic007G161200 Sobic007G161200 Sobic002G375800--Sobic007G161200 Sobic005G020900 Sobic005G020900 Sobic002G375800--Sobic005G020900 Sobic008G032600 Sobic008G032600 Sobic002G375800--Sobic008G032600 Sobic009G139800 Sobic009G139800 Sobic008G113600--Sobic009G139800 Sobic003G169900 Sobic003G169900 Sobic008G113600--Sobic003G169900 Sobic008G113600--Sobic002G375800 Sobic001G220900 Sobic001G220900 Sobic008G113600--Sobic001G220900 Sobic001G338400 Sobic001G338400 Sobic008G113600--Sobic001G338400 Sobic007G075500 Sobic007G075500 Sobic008G113600--Sobic007G075500 Sobic003G348800 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Octagon: transcription factors


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