Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G109500.1
Synonym Sb03g009200
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XFN5
Pfam PF07889
Panther DB PTHR31903 PTHR31903:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G24265 : Protein of unknown function (DUF1664)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g01070.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043352 , Zm00025a035382
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G126600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12822: RBM25, RNA-binding protein 25
2 Sobic.008G015500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K13093: HIV Tat-specific factor 1
3 Sobic.003G119000 XRN 5\'-3\' exonuclease N-terminus domain containing protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
4 Sobic.008G192600 serine/threonine-protein kinase PRP4, putative, expressed K08827: serine/threonine-protein kinase PRP4
5 Sobic.003G108700 RNA recognition motif, putative, expressed -
6 Sobic.006G251900 - -
7 Sobic.001G347300 splicing factor, arginine/serine-rich 16, putative, expressed K13168: splicing factor, arginine/serine-rich 16
8 Sobic.007G167500 expressed protein -
9 Sobic.002G404700 expressed protein K11367: chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1
10 Sobic.003G038500 SSRP1-like FACT complex subunit, putative, expressed K09272: structure-specific recognition protein 1
11 Sobic.009G209300 starch synthase, putative, expressed -
12 Sobic.006G048500 - -
13 Sobic.006G048600 - -
14 Sobic.003G401600 expressed protein K12879: THO complex subunit 2
15 Sobic.004G216500 hypothetical protein -
16 Sobic.004G257400 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G243900 - -
18 Sobic.009G026500 ATSIZ1/SIZ1, putative, expressed -
19 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
20 Sobic.002G145101 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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