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Transcriptome id Sobic.004G097500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YNN9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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1 Sobic.008G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.8 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
2 Sobic.007G213700 -(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, putative, expressed K00830: alanine-glyoxylate transaminase / serine-glyoxylate transaminase / serine-pyruvate transaminase
3 Sobic.004G272600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.008G101400 - -
5 Sobic.009G171300 PX domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G189300 Chorophyll a/b binding protein 8(PubMedID : 26186930)@photosystem I light harvesting complex gene 3(PubMedID : 26465154)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08909: light-harvesting complex I chlorophyll a/b binding protein 3
7 Sobic.005G055900 expressed protein -
8 Sobic.002G000700 expressed protein -
9 Sobic.004G144700 ABC transporter family protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G066600 mTERF domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G201700 glycosyl transferase family 17 protein, putative, expressed K00737: beta-1,4-mannosyl-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase
12 Sobic.005G111200 PB1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G435500 tentative name(PubMedID : 31536532)@core histone H2A/H2B/H3/H4, putative, expressed -
14 Sobic.001G078400 OsSigP2 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed K03100: signal peptidase I
15 Sobic.005G099700 expressed protein -
16 Sobic.002G064000 expressed protein -
17 Sobic.001G068301 - K16189: phytochrome-interacting factor 4
18 Sobic.004G125200 - -
19 Sobic.002G145200 - -
20 Sobic.007G136900 Chorophyll a/b binding protein 4(PubMedID : 26186930)@Light harvesting complex PSI subunit A4 (At)(PubMedID : 27208977)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08910: light-harvesting complex I chlorophyll a/b binding protein 4


Gene co-expression network
sample Sobic004G097500 Sobic004G097500 Sobic008G015100 Sobic008G015100 Sobic004G097500--Sobic008G015100 Sobic007G213700 Sobic007G213700 Sobic004G097500--Sobic007G213700 Sobic004G272600 Sobic004G272600 Sobic004G097500--Sobic004G272600 Sobic008G101400 Sobic008G101400 Sobic004G097500--Sobic008G101400 Sobic009G171300 Sobic009G171300 Sobic004G097500--Sobic009G171300 Sobic010G189300 Sobic010G189300 Sobic004G097500--Sobic010G189300 Sobic005G055900 Sobic005G055900 Sobic004G097500--Sobic005G055900 Sobic002G000700 Sobic002G000700 Sobic004G097500--Sobic002G000700 Sobic004G144700 Sobic004G144700 Sobic004G097500--Sobic004G144700 Sobic008G015100--Sobic010G189300 Sobic008G015100--Sobic004G272600 Sobic001G070500 Sobic001G070500 Sobic008G015100--Sobic001G070500 Sobic001G435500 Sobic001G435500 Sobic008G015100--Sobic001G435500 Sobic007G136900 Sobic007G136900 Sobic008G015100--Sobic007G136900 Sobic005G099700 Sobic005G099700 Sobic008G015100--Sobic005G099700 Sobic007G223500 Sobic007G223500 Sobic008G015100--Sobic007G223500 Sobic008G015100--Sobic008G101400 Sobic005G111200 Sobic005G111200 Sobic008G015100--Sobic005G111200 Sobic007G204900 Sobic007G204900 Sobic007G213700--Sobic007G204900 Sobic007G213700--Sobic002G000700 Sobic003G305000 Sobic003G305000 Sobic007G213700--Sobic003G305000 Sobic004G201700 Sobic004G201700 Sobic007G213700--Sobic004G201700 Sobic006G249050 Sobic006G249050 Sobic007G213700--Sobic006G249050 Sobic004G122200 Sobic004G122200 Sobic007G213700--Sobic004G122200 Sobic001G003200 Sobic001G003200 Sobic007G213700--Sobic001G003200 Sobic006G135100 Sobic006G135100 Sobic007G213700--Sobic006G135100 Sobic001G158900 Sobic001G158900 Sobic007G213700--Sobic001G158900 Sobic004G272600--Sobic001G070500 Sobic004G272600--Sobic010G189300 Sobic003G052500 Sobic003G052500 Sobic004G272600--Sobic003G052500 Sobic002G033900 Sobic002G033900 Sobic004G272600--Sobic002G033900 Sobic006G073500 Sobic006G073500 Sobic004G272600--Sobic006G073500 Sobic004G071800 Sobic004G071800 Sobic004G272600--Sobic004G071800 Sobic004G235200 Sobic004G235200 Sobic004G272600--Sobic004G235200 Sobic004G272600--Sobic008G015100 Sobic009G229700 Sobic009G229700 Sobic004G272600--Sobic009G229700 Sobic008G101400--Sobic008G015100 Sobic008G101400--Sobic004G201700 Sobic008G101400--Sobic010G189300 Sobic002G316700 Sobic002G316700 Sobic008G101400--Sobic002G316700 Sobic009G062500 Sobic009G062500 Sobic008G101400--Sobic009G062500 Sobic009G164300 Sobic009G164300 Sobic008G101400--Sobic009G164300 Sobic008G101400--Sobic007G136900 Sobic008G101400--Sobic007G223500 Sobic008G101400--Sobic001G435500 Sobic009G171300--Sobic005G099700 Sobic003G163700 Sobic003G163700 Sobic009G171300--Sobic003G163700 Sobic009G171300--Sobic008G015100 Sobic009G171300--Sobic004G272600 Sobic009G171300--Sobic005G111200 Sobic009G171300--Sobic010G189300 Sobic001G066600 Sobic001G066600 Sobic009G171300--Sobic001G066600 Sobic001G463200 Sobic001G463200 Sobic009G171300--Sobic001G463200 Sobic009G171300--Sobic008G101400 Sobic010G189300--Sobic001G070500 Sobic010G189300--Sobic007G136900 Sobic001G046900 Sobic001G046900 Sobic010G189300--Sobic001G046900 Sobic010G189300--Sobic006G073500 Sobic002G352100 Sobic002G352100 Sobic010G189300--Sobic002G352100 Sobic010G189300--Sobic002G033900 Sobic010G189300--Sobic009G229700 Sobic010G189300--Sobic004G235200 Sobic005G087000 Sobic005G087000 Sobic010G189300--Sobic005G087000 Sobic005G055900--Sobic001G435500 Sobic003G088800 Sobic003G088800 Sobic005G055900--Sobic003G088800 Sobic002G337001 Sobic002G337001 Sobic005G055900--Sobic002G337001 Sobic005G055900--Sobic003G163700 Sobic001G275200 Sobic001G275200 Sobic005G055900--Sobic001G275200 Sobic005G055900--Sobic004G144700 Sobic010G128000 Sobic010G128000 Sobic005G055900--Sobic010G128000 Sobic005G203900 Sobic005G203900 Sobic005G055900--Sobic005G203900 Sobic005G055900--Sobic006G135100 Sobic003G137100 Sobic003G137100 Sobic002G000700--Sobic003G137100 Sobic002G358500 Sobic002G358500 Sobic002G000700--Sobic002G358500 Sobic002G000700--Sobic007G213700 Sobic004G001300 Sobic004G001300 Sobic002G000700--Sobic004G001300 Sobic002G000700--Sobic006G249050 Sobic001G060401 Sobic001G060401 Sobic002G000700--Sobic001G060401 Sobic002G000700--Sobic007G204900 Sobic010G164200 Sobic010G164200 Sobic002G000700--Sobic010G164200 Sobic007G150100 Sobic007G150100 Sobic002G000700--Sobic007G150100 Sobic004G144700--Sobic008G015100 Sobic004G144700--Sobic005G055900 Sobic008G060150 Sobic008G060150 Sobic004G144700--Sobic008G060150 Sobic004G144700--Sobic003G163700 Sobic004G144700--Sobic001G066600 Sobic004G144700--Sobic009G171300 Sobic004G144700--Sobic001G435500 Sobic004G144700--Sobic010G189300 Sobic004G144700--Sobic003G088800
Octagon: transcription factors


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