Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G175000.1
Synonym Sb04g022520
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XU75
Pfam -
Panther DB PTHR31509 PTHR31509:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22030 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g34710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020632
Brachypodium KQJ99863
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G175000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G086900 pectinesterase, putative, expressed -
2 Sobic.001G184800 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR52 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
3 Sobic.004G291800 - -
4 Sobic.004G045566 - -
5 Sobic.006G022500 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G291700 CPuORF25 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K05929: E2.1.1.103, phosphoethanolamine N-methyltransferase
7 Sobic.003G420201 - -
8 Sobic.008G083700 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G420300 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G067100 ribosome inactivating protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G104200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G029500 cation efflux family protein, putative, expressed K14689: SLC30A2, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2
14 Sobic.009G109450 - -
15 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
16 Sobic.001G261537 - -
17 Sobic.003G204000 expressed protein -
18 Sobic.001G433200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
19 Sobic.005G099150 - -
20 Sobic.003G223700 hydroquinone glucosyltransferase, putative, expressed K08237: hydroquinone glucosyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G175000 Sobic004G175000 Sobic006G086900 Sobic006G086900 Sobic004G175000--Sobic006G086900 Sobic001G184800 Sobic001G184800 Sobic004G175000--Sobic001G184800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic004G175000--Sobic004G291800 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic004G175000--Sobic004G045566 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G175000--Sobic006G022500 Sobic004G291700 Sobic004G291700 Sobic004G175000--Sobic004G291700 Sobic003G420201 Sobic003G420201 Sobic004G175000--Sobic003G420201 Sobic008G083700 Sobic008G083700 Sobic004G175000--Sobic008G083700 Sobic002G420300 Sobic002G420300 Sobic004G175000--Sobic002G420300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic006G086900--Sobic010G237650 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic006G086900--Sobic002G297800 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic006G086900--Sobic005G128000 Sobic009G257300 Sobic009G257300 Sobic006G086900--Sobic009G257300 Sobic002G108600 Sobic002G108600 Sobic006G086900--Sobic002G108600 Sobic009G228201 Sobic009G228201 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Octagon: transcription factors


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