Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G044000.1
Synonym Sb05g003630, NHL1
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5Y538
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31415 PTHR31415:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11660 : NDR1/HIN1-like 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g05860.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053953 , Zm00025a033680
Brachypodium KQJ89363 , KQJ92163
Barley HORVU4Hr1G021190.1 , HORVU4Hr1G021190.3 , HORVU4Hr1G021190.2 , HORVU5Hr1G040160.1 , HORVU5Hr1G040160.2 , HORVU5Hr1G040160.3 , HORVU5Hr1G040160.4 , HORVU5Hr1G040160.5 , HORVU5Hr1G040160.6
Wheat TraesCS5B02G125000 , TraesCS5A02G125800 , TraesCS5D02G133400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G044000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G231700 LSM domain containing protein, expressed K12626: U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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