Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G235900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PNK4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G235800 expressed protein -
2 Sobic.006G247900 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01952: PFAS, phosphoribosylformylglycinamidine synthase
3 Sobic.004G016000 spermidine synthase, putative, expressed K00797: speE, SRM, spermidine synthase
4 Sobic.007G054800 valyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01873: VARS, valyl-tRNA synthetase
5 Sobic.001G110600 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G135200 importin subunit beta, putative, expressed K14293: KPNB1, importin subunit beta-1
7 Sobic.001G404600 expressed protein K18270: Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit
8 Sobic.008G088857 - -
9 Sobic.006G247100 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
10 Sobic.009G133500 expressed protein -
11 Sobic.002G231500 phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K01923: phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase
12 Sobic.008G003700 clathrin heavy chain, putative, expressed K04646: clathrin heavy chain
13 Sobic.009G243800 transporter family protein, putative, expressed K08145: SLC2A8, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 8
14 Sobic.008G033500 nucleolar GTPase, putative, expressed -
15 Sobic.009G139900 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
16 Sobic.001G193300 TBC domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G447300 ATP-binding cassette sub-family E member 1, putative, expressed K06174: ABCE1, ATP-binding cassette, sub-family E, member 1
18 Sobic.002G335600 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
19 Sobic.001G287500 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09533: DnaJ homolog subfamily C member 13
20 Sobic.009G073100 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3


Gene co-expression network
sample Sobic006G235900 Sobic006G235900 Sobic006G235800 Sobic006G235800 Sobic006G235900--Sobic006G235800 Sobic006G247900 Sobic006G247900 Sobic006G235900--Sobic006G247900 Sobic004G016000 Sobic004G016000 Sobic006G235900--Sobic004G016000 Sobic007G054800 Sobic007G054800 Sobic006G235900--Sobic007G054800 Sobic001G110600 Sobic001G110600 Sobic006G235900--Sobic001G110600 Sobic008G135200 Sobic008G135200 Sobic006G235900--Sobic008G135200 Sobic001G404600 Sobic001G404600 Sobic006G235900--Sobic001G404600 Sobic008G088857 Sobic008G088857 Sobic006G235900--Sobic008G088857 Sobic006G247100 Sobic006G247100 Sobic006G235900--Sobic006G247100 Sobic006G235800--Sobic006G235900 Sobic001G127200 Sobic001G127200 Sobic006G235800--Sobic001G127200 Sobic001G193300 Sobic001G193300 Sobic006G235800--Sobic001G193300 Sobic006G034500 Sobic006G034500 Sobic006G235800--Sobic006G034500 Sobic001G312900 Sobic001G312900 Sobic006G235800--Sobic001G312900 Sobic009G243800 Sobic009G243800 Sobic006G235800--Sobic009G243800 Sobic008G003700 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Octagon: transcription factors


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