Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G256700.1
Synonym Sb06g032020
Functional annotation VQ domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YA01
Pfam PF05678
Panther DB PTHR33143
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58000 : VQ motif-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g57030.1 : VQ domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G217700 clathrin assembly protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G112832 - -
3 Sobic.001G503600 expressed protein -
4 Sobic.001G039100 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G015200 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G050900 expressed protein -
7 Sobic.004G318900 stage II sporulation protein E, putative, expressed -
8 Sobic.005G074300 - -
9 Sobic.003G064100 expressed protein -
10 Sobic.001G272100 expressed protein -
11 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
12 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
13 Sobic.005G049900 - -
14 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
15 Sobic.002G298201 - K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
16 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
17 Sobic.009G042800 expressed protein -
18 Sobic.003G317000 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
19 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
20 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G256700 Sobic006G256700 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic006G256700--Sobic010G217700 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic006G256700--Sobic007G112832 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic006G256700--Sobic001G503600 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic006G256700--Sobic001G039100 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic006G256700--Sobic002G015200 Sobic008G050900 Sobic008G050900 Sobic006G256700--Sobic008G050900 Sobic004G318900 Sobic004G318900 Sobic006G256700--Sobic004G318900 Sobic005G074300 Sobic005G074300 Sobic006G256700--Sobic005G074300 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic006G256700--Sobic003G064100 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic010G217700--Sobic007G161100 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic010G217700--Sobic001G196400 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic010G217700--Sobic004G059200 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic010G217700--Sobic003G208900 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic010G217700--Sobic004G327000 Sobic004G348000 Sobic004G348000 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Octagon: transcription factors


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